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(Referência obtida automaticamente do Web of Science, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

GHap: an R package for genome-wide haplotyping

Texto completo
Autor(es):
Utsunomiya, Yuri T. ; Milanesi, Marco ; Utsunomiya, Adam T. H. ; Ajmone-Marsan, Paolo ; Garcia, Jose F.
Número total de Autores: 5
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: Bioinformatics; v. 32, n. 18, p. 2861-2862, SEP 15 2016.
Citações Web of Science: 7
Resumo

The GHap R package was designed to call haplotypes from phased marker data. Given user-defined haplotype blocks (HapBlock), the package identifies the different haplotype alleles (HapAllele) present in the data and scores sample haplotype allele genotypes (HapGenotype) based on HapAllele dose (i.e. 0, 1 or 2 copies). The output is not only useful for analyses that can handle multi-allelic markers, but is also conveniently formatted for existing pipelines intended for bi-allelic markers. (AU)

Processo FAPESP: 14/01095-8 - Utilização de sequenciamento de nova geração para o mapeamento fino de regiões cromossômicas que afetam o perímetro escrotal de touros Nelore
Beneficiário:Yuri Tani Utsunomiya
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado