Glioma CpG island methylator phenotype (G-CIMP): biological and clinical implications

Autor(es)

Malta, Tathiane M. ^{[1, 2]} ; de Souza, Camila F. ^{[1, 2]} ; Sabedot, Thais S. ^{[1, 2]} ; Silva, Tiago C. ^[1] ; Mosella, Maritza S. ^[1] ; Kalkanis, Steven N. ^[2] ; Snyder, James ^{[2, 3]} ; Castro, Ana Valeria B. ^[2] ; Noushmehr, Houtan ^{[1, 2]}

Afiliação do(s) autor(es)

^[1] Univ Sao Paulo, Ribeirao Preto Med Sch, Dept Genet, Sao Paulo - Brazil

^[2] Henry Ford Hosp, Dept Neurosurg, 2799 West Grand Blvd, Detroit, MI 48202 - USA

^[3] Henry Ford Hosp, Dept Neurol, Detroit, MI 48202 - USA

• Tipo de documento: Artigo de Revisão
• Fonte: NEURO-ONCOLOGY; v. 20, n. 5, p. 608-620, MAY 2018.
• Citações Web of Science: 19

Resumo

Gliomas are a heterogeneous group of brain tumors with distinct biological and clinical properties. Despite advances in surgical techniques and clinical regimens, treatment of high-grade glioma remains challenging and carries dismal rates of therapeutic success and overall survival. Challenges include the molecular complexity of gliomas, as well as inconsistencies in histopathological grading, resulting in an inaccurate prediction of disease progression and failure in the use of standard therapy. The updated 2016 World Health Organization (WHO) classification of tumors of the central nervous system reflects a refinement of tumor diagnostics by integrating the genotypic and phenotypic features, thereby narrowing the defined subgroups. The new classification recommends molecular diagnosis of isocitrate dehydrogenase (IDH) mutational status in gliomas. IDH-mutant gliomas manifest the cytosine-phosphate-guanine (CpG) island methylator phenotype (G-CIMP). Notably, the recent identification of clinically relevant subsets of G-CIMP tumors (G-CIMP-high and G-CIMP-low) provides a further refinement in glioma classification that is independent of grade and histology. This scheme may be useful for predicting patient outcome and may be translated into effective therapeutic strategies tailored to each patient. In this review, we highlight the evolution of our understanding of the G-CIMP subsets and how recent advances in characterizing the genome and epigenome of gliomas may influence future basic and translational research. (AU)

• Processo FAPESP: 16/06488-3 - Análise integrativa do epigenoma de gliomas com fenótipo metilador de ilhas CpG (G-CIMP) alto e baixo: caracterização e desenvolvimento
• Beneficiário: Thaís Sarraf Sabedot
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Processo FAPESP: 16/15485-8 - Biomarcadores clínicos em tumores do sistema nervoso central
• Beneficiário: Camila Ferreira de Souza
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 14/08321-3 - Identificação e caracterização de elementos genômicos funcionais associados com a progressão de gliomas de baixo grau a gliomas de alto grau: estudo integrado do genoma e epigenoma
• Beneficiário: Camila Ferreira de Souza
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 16/12329-5 - Alterações na metilação do DNA e acessibilidade da cromatina associadas a gliomas com fenótipo metilador de ilhas CpG (G-CIMP) alto e baixo
• Beneficiário: Thaís Sarraf Sabedot
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
• Processo FAPESP: 16/10436-9 - Desenvolvimento e melhoria de ferramentas de bioinformática para integrar e compreender as mudanças epigenômicas e genômicas aberrantes associadas com câncer: métodos, desenvolvimento e análise
• Beneficiário: Tiago Chedraoui Silva
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
• Processo FAPESP: 15/07925-5 - Softwares de código aberto contendo ferramentas estatísticas para análise e integração de conjuntos de dados epigenômicos produzidos em alta escala, a fim de decifrar e entender redes reguladoras de câncer
• Beneficiário: Houtan Noushmehr
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
• Processo FAPESP: 16/01975-3 - Definindo assinaturas epigenômicas de células-tronco em 33 diferentes tipos de tumores em um grupo de mais de 9000 amostras
• Beneficiário: Tathiane Maistro Malta Pereira
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 14/02245-3 - Identificação de assinaturas epigenômicas que definem regiões regulatórias ativas do genoma associadas à diferenciação mesenquimal a partir de células-tronco pluripotentes humanas
• Beneficiário: Tathiane Maistro Malta Pereira
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 16/01389-7 - Ferramenta de bioinformática para integrar e compreender as mudanças epigenômicas e genômicas aberrantes associadas com câncer: métodos, desenvolvimento e análise
• Beneficiário: Tiago Chedraoui Silva
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Processo FAPESP: 16/11039-3 - Traçando Assinaturas epigenômicas de tumores com Fenótipo de Ilhas CpG Metiladas (CIMP)
• Beneficiário: Maritza Queiroz Salas Mosella
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado