Network of proteins, enzymes and genes linked to biomass degradation shared by Trichoderma species

Autor(es)

Crivelente Horta, Maria Augusta ^[1] ; Ferreira Filho, Jaire Alves ^[1] ; Murad, Natalia Faraj ^[1] ; Santos, Eidy de Oliveira ^[2] ; dos Santos, Clelton Aparecido ^[1] ; Mendes, Juliano Sales ^[1] ; Brandao, Marcelo Mendes ^[1] ; Azzoni, Sindelia Freitas ^[3] ; de Souza, Anete Pereira ^{[1, 4]}

Afiliação do(s) autor(es)

^[1] Univ Campinas UNICAMP, Ctr Mol Biol & Genet Engn CBMEG, Campinas, SP - Brazil

^[2] West Zone State Univ UEZO, Univ Unit Biol, Rio De Janeiro, RJ - Brazil

^[3] Brazilian Ctr Res Energy & Mat CNPEM, Bioethanol Sci & Technol Lab CTBE, Campinas, SP - Brazil

^[4] Univ Campinas UNICAMP, Biol Inst, Dept Plant Biol, Campinas, SP - Brazil

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: SCIENTIFIC REPORTS; v. 8, JAN 22 2018.
• Citações Web of Science: 5

Resumo

Understanding relationships between genes responsible for enzymatic hydrolysis of cellulose and synergistic reactions is fundamental for improving biomass biodegradation technologies. To reveal synergistic reactions, the transcriptome, exoproteome, and enzymatic activities of extracts from Trichoderma harzianum, Trichoderma reesei and Trichoderma atroviride under biodegradation conditions were examined. This work revealed co-regulatory networks across carbohydrate-active enzyme (CAZy) genes and secreted proteins in extracts. A set of 80 proteins and respective genes that might correspond to a common system for biodegradation from the studied species were evaluated to elucidate new co-regulated genes. Differences such as one unique base pair between fungal genomes might influence enzyme-substrate binding sites and alter fungal gene expression responses, explaining the enzymatic activities specific to each species observed in the corresponding extracts. These differences are also responsible for the different architectures observed in the co-expression networks. (AU)

• Processo FAPESP: 11/00417-3 - Biologia de sistemas aplicada a agricultura: análise de transcriptomas e interactomas
• Beneficiário: Marcelo Mendes Brandao
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
• Processo FAPESP: 14/18856-1 - Estudo da expressão gênica global e de regiões genômicas associadas ao controle da expressão de enzimas envolvidas na degradação de compostos lignocelulósicos por Trichoderma harzianum
• Beneficiário: Maria Augusta Crivelente Horta
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 15/09202-0 - Estudo de regiões genômicas de Trichoderma harzianum associadas ao controle da expressão de enzimas envolvidas na degradação de biomassa
• Beneficiário: Anete Pereira de Souza
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Processo FAPESP: 15/50612-8 - An integrated approach to explore a novel paradigm for biofuel production from lignocellulosic feedstocks
• Beneficiário: Telma Teixeira Franco
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Processo FAPESP: 16/19775-0 - Desenvolvimento / suplementação de coquetéis enzimáticos destinados à hidrólise de biomassa vegetal: utilização de mutagênese sítio-dirigida e proteínas quiméricas
• Beneficiário: Clelton Aparecido dos Santos
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado