Complete Chromosome-Scale Genome Sequence Resource for Sporisorium panici-leucophaei, the Causal Agent of Sourgrass Smut Disease

Autor(es)

Crestana, Gustavo Schiavone ^[1] ; Taniguti, Lucas Mitsuo ^[2] ; dos Santos, Clesivan Pereira ^[1] ; Benevenuto, Juliana ^[1] ; Ceresini, Paulo Cezar ^[3] ; Carvalho, Giselle ^[4] ; Kitajima, Joao Paulo ^[2] ; Monteiro-Vitorello, Claudia Barros ^[1]

Afiliação do(s) autor(es)

^[1] Univ Sao Paulo, Dept Genet, Genom Grp, Luiz de Queiroz Coll Agr, USP ESALQ, BR-13418900 Piracicaba, SP - Brazil

^[2] Mendel Anal Genom SA, BR-04013000 Sao Paulo, SP - Brazil

^[3] Sao Paulo State Univ UNESP, Plant Hlth Rural Engn & Soils Dept, Mol Phytopathol Lab, BR-15385000 Ilha Solteira, SP - Brazil

^[4] SENAI Innovat Inst Biomass, BR-79640250 Tres Lagoas, MS - Brazil

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS; v. 34, n. 4, p. 448-452, APR 2021.
• Citações Web of Science: 0

Resumo

Here, we present the first complete chromosome-level genome assembly of the smut fungus strain Sporisorium panici-leucophaei SPL10A, the causal agent of the sourgrass (Digitaria insularis) smut disease. Combining Illumina paired-end and Nanopore long reads, we generated a final assembly composed of 23 chromosomes (22 nuclear and one mitochondrial) with 18,915,934 bp. Gene prediction accomplished using extrinsic evidence from the sugarcane smut fungus Sporisorium scitamineum originated a total of 6,402 protein-encoding genes. The secretome (388 proteins) and the effectorome repertoires (68 candidates) were also predicted, given their crucial roles in plant-pathogen interactions. The complete telomere-to-telomere chromosome sequences of this poorly studied fungus will provide a valuable resource for future comparative genomic studies among smuts to unravel their underlying pathogenicity mechanisms. (AU)

• Processo FAPESP: 18/24028-5 - Estudos sobre interação Sporisorium panici-leucophaei e Digitaria insularis
• Beneficiário: Gustavo Schiavone Crestana
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Processo FAPESP: 17/13268-2 - Estudos genômicos e funcionais da interação Sporisorium scitamineum-cana e de outros fungos causadores do carvão: avanços e desafios
• Beneficiário: Claudia Barros Monteiro Vitorello
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Processo FAPESP: 16/17545-8 - Contribuição de genes, genomas e elementos de transposição na interação entre plantas e micro-organismos: estudo de caso em cana-de-açúcar
• Beneficiário: Marie-Anne Van Sluys
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOEN - Temático