Oral cavities of healthy infants harbour high proportions of Streptococcus salivarius strains with phenotypic and genotypic resistance to multiple classes of antibiotics

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Palma, Thais H. ; Harth-Chu, Erika N. ; Scott, Jodie ; Stipp, Rafael N. ; Boisvert, Heike ; Salomao, Mariana F. ; Theobaldo, Jessica D. ; Possobon, Rosana F. ; Nascimento, Leandro C. ; McCafferty, Jonathan W. ; Faller, Lina ; Duncan, Margaret J. ; Mattos-Graner, Renata O.

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: Journal of Medical Microbiology; v. 65, p. 9-pg., 2016-12-01.

Resumo

Emerging antibiotic resistance in the oropharyngeal microbiota, of which Streptococcus salivarius is a prominent species, represents a challenge for treating paediatric populations. In this study, we investigated the role of Streptococcus salivarius as a reservoir for antibiotic resistance genes (ARG) in the oral microbiota by analysing 95 Streptococcus salivarius isolates from 22 healthy infants (2-16 months of age). MICs of penicillin G, amoxicillin, erythromycin, tetracycline, doxycycline and streptomycin were determined. ARG profiles were assessed in a subset of 21 strains by next-generation sequencing of genomes, followed by searches of assembled reads against the Comprehensive Antibiotic Resistance Database. Strains resistant to erythromycin, penicillins and tetracyclines were isolated from 83.3, 33.3 and 16.6 %, respectively, of infants aged 2 to 8 months with no prior antibiotic treatment. These percentages were 100.0, 66.6 and 50.0 %, by 13 to 16 months of age. ARG or polymorphisms associated with antibiotic resistance were the most prevalent and involved genes for macrolide efflux (mel, mefA/E and macB), ribosomal protection [erm(B), tet(M) and tet(O)] and beta-lactamase-like proteins. Phylogenetically related strains showing multidrug-resistant phenotypes harboured multidrug efflux ARG. Polymorphic genes associated with antibiotic resistance to drugs affecting DNA replication, folate synthesis, RNA/protein synthesis and regulators of antibiotic stress responses were detected. These data imply that Streptococcus salivarius strains established during maturation of the oral microbiota harbour a diverse array of functional ARG, even in the absence of antibiotic selective pressures, highlighting a potential role for this species in shaping antibiotic susceptibility profiles of oropharyngeal communities. (AU)

• Processo FAPESP: 13/06820-0 - Análise do perfil de sensibilidade a antibióticos de cepas de Streptococcus pioneiras da cavidade bucal
• Beneficiário: Thaís Harder de Palma
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Iniciação Científica
• Processo FAPESP: 10/06785-1 - Análise filogenética de cepas de Streptococcus dos grupos Mitis e Sanguinis isolados da cavidade bucal crianças durante as fases iniciais de colonização
• Beneficiário: Jessica Dias Theobaldo
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Processo FAPESP: 09/50547-0 - Characterization of GbpB/PcsB homologues in commensal species of oral streptococci
• Beneficiário: Erika Nikitza Shiauha Harth Chu
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 10/06786-8 - Análise da colonização bucal de crianças com 2 a 16 meses de idade por espécies não-hemolíticas do gênero Streptococcus
• Beneficiário: Mariana da Fonseca
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Processo FAPESP: 15/12940-3 - Identificação de proteínas de superfície de Streptococcus mutans implicadas no escape à opsonização pelo sistema complemento
• Beneficiário: Renata de Oliveira Mattos Graner
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Processo FAPESP: 12/51832-3 - Caracterização de um novo sistema de dois componentes com provável função na adaptação de Streptococcus mutans e Streptococcus sanguinis a saliva humana
• Beneficiário: Renata de Oliveira Mattos Graner
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Processo FAPESP: 11/09761-9 - Análise do perfil de sensibilidade a antibióticos de cepas de Streptococcus pioneiras da cavidade bucal
• Beneficiário: Thaís Harder de Palma
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica