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(Referência obtida automaticamente do Web of Science, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

DETECTION OF THE SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM (rs2227307) IN THE HUMAN INTERLEUKIN 8 GENE USING A PCR-RFLP ASSAY

Autor(es):
Kim, Yeon Jung [1] ; Viana, Aline Cavalcanti ; Tfaile Corbi, Samia Cruz ; de Carvalho Curtis, Karen Maria [2] ; Renzi, Rivelto ; Perez Orrico, Silvana Regina [3] ; Cirelli, Joni Augusto [3] ; Scarel-Caminaga, Raquel Mantuaneli [4]
Número total de Autores: 8
Afiliação do(s) autor(es):
[1] Univ Estadual Paulista, UNESP, Fac Odontol Araraquara FOAr, Araraquara, SP - Brazil
[2] UNESP, Inst Quim Araraquara, Araraquara, SP - Brazil
[3] UNESP, FOAr, Disciplina Periodontia, Araraquara, SP - Brazil
[4] UNESP, FOAr, Disciplina Genet Humana, Araraquara, SP - Brazil
Número total de Afiliações: 4
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: BIOSCIENCE JOURNAL; v. 25, n. 6, p. 136-142, NOV-DEC 2009.
Citações Web of Science: 2
Resumo

Interleukin 8 (IL-8) is a chemokine that acts as a potent chemoattractant for neutrophils. Single nucleotide polymorphisms ( SNPs) in the human IL8 gene have been investigated in many disease association studies. We have developed a different PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction - Restriction Fragment of Length Polymorphism) assay for genotyping the SNP (rs2227307) in the IL8 gene. This method was used for typing 147 white healthy Brazilian individuals, whose DNA was obtained from buccal epithelial cells and extracted with phenol: chloroform: isoamyl alcohol. Genomic DNA was amplified by PCR using a conventional thermal cycler. The PCR products ( 573 bp) were submitted to RFLP reactions. The RFLP fragments were analyzed in a 4% agarose gel stained with ethidium bromide. The genotype distribution observed in this study was consistent with the assumption of Hardy-Weinberg equilibrium and was similar (p=0.30) to those reported for other white populations in the SNP Database of the National Center for Biotechnology Information (NCBI). Because the PCR-RFLP method presented here was efficient, low cost, reproducible and convenient for laboratories with a limited level of technology worldwide, it should be useful for genotyping in case-control association or population genetic studies. (AU)

Processo FAPESP: 03/10424-0 - Investigação de polimorfismos no gene interleucina 8 e seus receptores em indivíduos com doença periodontal crônica
Beneficiário:Raquel Mantuaneli Scarel Caminaga
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Regular
Processo FAPESP: 05/04553-8 - Investigação de polimorfismos no gene da interleucina 10 em indivíduos com periodontite agressiva
Beneficiário:Patrícia Mayumi Sogumo
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Processo FAPESP: 05/03231-7 - Investigação de polimorfismos no promotor do gene interleucina 8 em indivíduos com doença periodontal crônica
Beneficiário:Yeon Jung Kim
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Mestrado
Processo FAPESP: 06/04492-1 - Investigação de polimorfismos no gene interleucina 8 e seus receptores em indivíduos com doença periodontal crônica
Beneficiário:Karen Maria de Carvalho Curtis
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico