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(Referência obtida automaticamente do Web of Science, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

Uncovering false positives on a virtual screening search for cruzain inhibitors

Texto completo
Autor(es):
Ferreira, Elizabeth Igne [1] ; Malvezzi, Alberto ; Rezende, Leandro de ; Izidoro, Mario Augusto ; Cezari, Maria Helena Sedenho ; Juliano, Luiz ; Amaral, Antonia T. -do
Número total de Autores: 7
Afiliação do(s) autor(es):
[1] Universidade de São Paulo (USP). Faculdade de Ciências Farmacêuticas. Departamento de Farmácia - Brasil
Número total de Afiliações: 7
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters; v. 18, n. 1, p. 350-354, Jan. 2008.
Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Farmácia
Assunto(s):Inibidores enzimáticos   Cisteína   Proteínas de protozoários
Resumo

Some unexpected promiscuous inhibitors were observed in a virtual screening protocol applied to select cruzain inhibitors from the ZINC database. Physical-chemical and pharmacophore model filters were used to reduce the database size. The selected compounds were docked into the cruzain active site. Six hit compounds were tested as inhibitors. Although the compounds were designed to be nucleophilically attacked by the catalytic cysteine of cruzain, three of them showed typical promiscuous behavior, revealing that false positives are a prevalent concern in VS programs. Graphical abstract: Promiscuous inhibition of cruzain is reported for three out of six virtual screening selected compounds. The promiscuous mechanism was assumed after the recovery of the enzyme activity following the addition of 0.1% Triton. (AU)

Processo FAPESP: 02/09518-8 - Relações quantitativas entre estrutura química e atividade biológica (QSAR/QSAR-ED) de compostos antichagásicos
Beneficiário:Alberto Malvezzi
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado
Processo FAPESP: 04/08928-3 - Desenvolvimento e aplicação de métodos computacionais de alto desempenho para análise de sistemas físicos e biológicos
Beneficiário:Luiz Nunes de Oliveira
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários
Processo FAPESP: 01/01192-3 - Antichagásicos potenciais derivados de compostos nitro-heterocíclicos
Beneficiário:Elizabeth Igne Ferreira
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Temático