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(Referência obtida automaticamente do Web of Science, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

Transcriptome meta-analysis of peripheral lymphomononuclear cells indicates that gestational diabetes is closer to type 1 diabetes than to type 2 diabetes mellitus

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Autor(es):
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Collares, C. V. A. [1, 2] ; Evangelista, A. F. [2] ; Xavier, D. J. [2] ; Takahashi, P. [2] ; Almeida, R. [2] ; Macedo, C. [2] ; Manoel-Caetano, F. [2] ; Foss, M. C. [3] ; Foss-Freitas, M. C. [3] ; Rassi, D. M. [1] ; Sakamoto-Hojo, E. T. [2, 4] ; Passos, G. A. [2] ; Donadi, E. A. [1, 2]
Número total de Autores: 13
Afiliação do(s) autor(es):
[1] Univ Sao Paulo, Fac Med Ribeirao Preto, Dept Med, Div Clin Immunol, BR-14049900 Ribeirao Preto, SP - Brazil
[2] Univ Sao Paulo, Fac Med Ribeirao Preto, Dept Genet, Mol Immunogenet Grp, BR-14049900 Ribeirao Preto, SP - Brazil
[3] Univ Sao Paulo, Fac Med Ribeirao Preto, Dept Med, Div Endocrinol, BR-14049900 Ribeirao Preto, SP - Brazil
[4] Univ Sao Paulo, Fac Philosophy Sci & Letters Ribeirao Preto, BR-14049 Ribeirao Preto, SP - Brazil
Número total de Afiliações: 4
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: MOLECULAR BIOLOGY REPORTS; v. 40, n. 9, p. 5351-5358, SEP 2013.
Citações Web of Science: 11
Resumo

We performed a meta-analysis of the transcription profiles of type 1, type 2 and gestational diabetes to evaluate similarities and dissimilarities among these diabetes types. cRNA samples obtained from peripheral blood lymphomononuclear cells (PBMC) of 56 diabetes mellitus patients (type 1 = 19; type 2 = 20; gestational = 17) were hybridized to the same whole human genome oligomicroarray platform, encompassing 44,000 transcripts. The GeneSpring software was used to perform analysis and hierarchical clustering, and the DAVID database was used for gene ontology. The gene expression profiles showed more similarity between gestational and type 1 diabetes rather than between type 2 and gestational diabetes, a finding that was not influenced by patient gender and age. The meta-analysis of the three types of diabetes disclosed 3,747 differentially and significantly expressed genes. A total of 486 genes were characteristic of gestational diabetes, 202 genes of type 1, and 651 genes of type 2 diabetes. 19 known genes were shared by type 1, type 2 and gestational diabetes, highlighting EGF, FAM46C, HBEGF, ID1, SH3BGRL2, VEPH1, and TMEM158 genes. The meta-analysis of PBMC transcription profiles characterized each type of diabetes revealing that gestational and type 1 diabetes were transcriptionally related. (AU)

Processo FAPESP: 10/12069-7 - Perfis de expressão gênica e possíveis interações entre microRNAs e mRNAs em diabetes mellitus tipo 1 com enfoque em resposta ao estresse oxidativo e reparo do DNA
Beneficiário:Paula Takahashi
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado
Processo FAPESP: 10/00932-2 - Perfis de expressão gênica associados ao processamento de dano oxidativo em pacientes com Diabetes Mellitus
Beneficiário:Fernanda da Silva Manoel Caetano
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Processo FAPESP: 10/05622-1 - Meta-análise do perfil de expressão gênica diferencial em pacientes com Diabetes Mellitus (DM-1, DM-2 e DMG)
Beneficiário:Cristhianna Viesti Advincula Collares
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Processo FAPESP: 08/56594-8 - Controle do transcriptoma no diabetes mellitus
Beneficiário:Geraldo Aleixo da Silva Passos Júnior
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Temático