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(Referência obtida automaticamente do Google Scholar, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

Crystal structures of beta-galactosidase from Penicillium sp. and its complex with galactose

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Autor(es):
Rojas, A. L. [1] ; Nagem, R. A. P. [2] ; Neustroev, K. N. ; Arand, M. ; Adamska, M. ; Eneyskaya, E. V. ; Kulminskaya, A. A. ; Garratt, R. C. ; Golubev, A. M. ; Polikarpov, I. [10]
Número total de Autores: 10
Afiliação do(s) autor(es):
[1] Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Física de São Carlos - Brasil
[2] Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Física de São Carlos - Brasil
[10] Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Física de São Carlos - Brasil
Número total de Afiliações: 10
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: Journal of Molecular Biology; v. 343, n. 5, p. 1281-1292, Nov. 2004.
Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica
Assunto(s):Biofísica   Fungos   Enzimas   Glicoproteínas   Penicillium
Resumo

Beta-galactosidases catalyze the hydrolysis of b(1-3) and b(1-4) galactosyl bonds in oligosaccharides as well as the inverse reaction of enzymatic condensation and transglycosylation. Here we report the crystallographic structures of Penicillium sp. b-galactosidase and its complex with galactose solved by the SIRAS quick cryo-soaking technique at 1.90 A ° and 2.10 A ° resolution, respectively. The amino acid sequence of this 120 kDa protein was first assigned putatively on the basis of inspection of the experimental electron density maps and then determined by nucleotide sequence analysis. Primary structure alignments reveal that Penicillium sp. b-galactosidase belongs to family 35 of glycosyl hydrolases (GHF-35). This model is the first 3D structure for a member of GHF-35. Five distinct domains which comprise the structure are assembled in a way previously unobserved for b-galactosidases. Superposition of this complex with other b-galactosidase complexes from several hydrolase families allowed the identification of residue Glu200 as the proton donor and residue Glu299 as the nucleophile involved in catalysis. Penicillium sp. b-galactosidase is a glycoprotein containing seven N-linked oligosaccharide chains and is the only structure of a glycosylated b-galactosidase described to date. (AU)

Processo FAPESP: 02/14208-8 - Determinação das estruturas cristalográficas de três glicosidases inéditas e de complexos glicosidases-substrato pelo método de crio derivatização rápida
Beneficiário:Ronaldo Alves Pinto Nagem
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Processo FAPESP: 01/07014-0 - Estudos estruturais de carbohidrases de fungos
Beneficiário:Adriana Lucely Rojas Cardona
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Processo FAPESP: 99/03387-4 - Estudos estruturais de proteínas usando luz síncrotron
Beneficiário:Igor Polikarpov
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Temático