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(Referência obtida automaticamente do Web of Science, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

MODULAR: software for the autonomous computation of modularity in large network sets

Texto completo
Autor(es):
Darcie Marquitti, Flavia Maria [1] ; Guimaraes, Jr., Paulo Roberto [1] ; Pires, Mathias Mistretta [1] ; Bittencourt, Luiz Fernando [2]
Número total de Autores: 4
Afiliação do(s) autor(es):
[1] Univ Sao Paulo, Depto Ecol, BR-05508900 Sao Paulo - Brazil
[2] Univ Estadual Campinas, Inst Computacao, BR-13083852 Campinas, SP - Brazil
Número total de Afiliações: 2
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: ECOGRAPHY; v. 37, n. 3, p. 221-224, MAR 2014.
Citações Web of Science: 78
Resumo

Many ecological systems can be represented as networks of interactions. A key feature in these networks is their organization into modules, which are subsets of tightly connected elements. We introduce MODULAR to perform rapid and autonomous calculation of modularity in network sets. MODULAR reads a set of files representing unipartite or bipartite networks, and identifies modules using two different modularity metrics widely used in the ecological networks literature. To estimate modularity, the software offers five optimization methods to the user. The software also includes two null models commonly used in studies of ecological networks to verify how the degree of modularity differs from two distinct theoretical benchmarks. (AU)

Processo FAPESP: 09/54422-8 - Estrutura e dinâmica coevolutiva em redes de interações mutualísticas
Beneficiário:Paulo Roberto Guimarães Junior
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Apoio a Jovens Pesquisadores
Processo FAPESP: 11/11346-0 - Parasitas de interações e a coevolução de mutualismos
Beneficiário:Flávia Maria Darcie Marquitti
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado
Processo FAPESP: 09/54567-6 - Redes tróficas do Pleistoceno: estrutura e fragilidade
Beneficiário:Mathias Mistretta Pires
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado
Processo FAPESP: 12/05935-5 - Dinâmica eco-evolutiva de interações mutualísticas
Beneficiário:Flávia Maria Darcie Marquitti
Linha de fomento: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado