Taxonomia molecular e caracterização genômica de genes regulados por vias de Quorum Sensing em isolados de bactérias láticas oriundas de diferentes matrizes alimentares

Resumo

As bactérias do ácido láctico (LAB) compõem um grupo parafilético que está relacionado a várias matrizes alimentares. Na fermentação espontânea de cacau, as LAB formam o principal grupo de bactérias envolvido em todo o processo de fermentação. O Projeto de doutorado direto fomentado pela FAPESP (Número 17/13759-6) busca entender a influência do Quorum Sensing (QS) na fermentação do cacau e visa desenvolver um coquetel bacteriano definido para padronizar a fermentação, selecionando linhagens LAB cuja atividade de QS foi detectada. A abordagem taxonômica para caracterizar os isolados LAB é muito importante porque é fundamental para relacionar a cepa à sua origem, habitat e fisiologia, o que impacta diretamente na seleção de novos microrganismos candidatos para aplicações em fermentações industriais padronizadas. Por outro lado, como as LAB são bem reconhecidas por possuírem Sistemas de QS de dois componentes (QS-TCSs), que são sistemas-chave em vias QS, uma análise genômica das LAB através do Sequenciamento do Genoma Completo (WGS) será útil para identificar in silico as sequências codificadoras putativas relacionadas a estes QS-TCSs, o que acarretará em vantagens para: (i) para projetar a cultura inicial proposta no projeto 17 / 13759-6 e, (ii) para comparar o esquema de taxonomia LAB com base em marcadores filogenéticos com as sequências de marcadores inteiras recuperadas dos genomas LAB montados. (AU)