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Papel do TSC22D3, um fator de transcrição de zíper de leucina induzido por glicocorticóide, no relógio molecular circadiano

Processo: 19/04451-3
Modalidade de apoio:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de julho de 2019
Data de Término da vigência: 30 de junho de 2020
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Fisiologia
Pesquisador responsável:Gisele Akemi Oda
Beneficiário:Danilo Eugênio de França Laurindo Flôres
Supervisor: John B Hogenesch
Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Instituição Anfitriã: Cincinnati Children's Hospital Medical Center, Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:17/16242-4 - Estudo computacional do fotoperiodismo na sincronização fótica e alimentar em sistemas circadianos multioscilatórios, BP.PD
Assunto(s):Cronobiologia   Ritmo circadiano   Genes de relógio
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:genes do relógio | Modelos Celulares | Osciladores circadianos | ritmos circadianos | Tsc22d3 | Cronobiologia

Resumo

Ritmos diários na fisiologia e no comportamento de mamíferos são regulados por um sistema circadiano, que é composto de um oscilador central no núcleo supraquiasmático (NSQ) e osciladores periféricos em quase todos os tecidos do organismo. Dentro dos osciladores central e periféricos, um ritmo autossustentado é gerado a partir de um mecanismo intracelular composto de alças interligadas de retroalimentação moleculares, baseadas na transcrição e tradução coordenadas de genes do relógio. O sistema circadiano interage com o eixo hipotálamo-hipófise-adrenal em diferentes pontos de regulação, resultando em um ritmo diário na liberação de glicocorticoides (GC) para a corrente sanguínea. Nos tecidos-alvo, o GC ativa a transcrição de genes alvo, dentre os quais está Tsc22d3, um fator de transcrição de zíper de leucina induzido por glicocorticoides. Este gene é ritmicamente expresso em diferentes tecidos de ratos, camundongos e humanos. Evidências bioquímicas indicam que o gene Tsc22dD3 pode funcionar como uma aferência, uma eferência ou um componente do mecanismo circadiano intracelular. Neste projeto BEPE, investigaremos o papel desempenhado pelo gene dentro dos osciladores circadianos, por meio de interferências genéticas sobre Tsc22dD3, seguidas da avaliação de efeitos na expressão dos genes do relógio. Em nosso primeiro objetivo, a função de Tsc22d3 será estudada em linhagens celulares de camundongos in vitro, por knockdown transcricional utilizando RNAi, em fibroblastos, adipócitos e hepatócitos. Posteriormente, uma inibição mais profunda será realizada com knockout completo, usando o sistema CRISPR/Cas9 para deletar grandes porções do gene. Interferências genéticas podem ter diferentes efeitos em células e tecidos complexos, como o NSQ. Portanto, como um segundo objetivo, observaremos a expressão dos genes do relógio em explantes de NSQ submetidos a knockdown ou superexpressão de Tsc22d3. Como terceiro objetivo, observaremos se outras vias bioquímicas são afetadas pela inibição, uma vez que o fator de transcrição pode funcionar como uma eferência. Para tanto, verificaremos o perfil das alterações transcricionais em larga escala no genoma de linhagens celulares, com RNA-seq, após a inibição de Tsc22d3. Finalmente, como último objetivo, iniciaremos o processo de geração de uma linhagem de camundongo knockout para Tsc22d3, utilizando o sistema CRISPR/Cas9, para futura avaliação de ritmos comportamentais e nos tecidos, sob inibição completa do gene. Este projeto sobre os mecanismos moleculares dos osciladores circadianos será um complemento conceitual e metodológico para o projeto atual de pós-doutorado com modelos genéricos de osciladores.

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
FLORES, DANILO E. F. L.; ODA, GISELE A.. Quantitative Study of Dual Circadian Oscillator Models under Different Skeleton Photoperiods. JOURNAL OF BIOLOGICAL RHYTHMS, v. 35, n. 3, . (19/04451-3, 17/16242-4, 17/19680-2)
STOKES, KYLE; NUNES, MALIKA; TROMBLEY, CHANTELLE; FLORES, DANILO E. F. L.; WU, GANG; TALEB, ZAINAB; ALKHATEEB, ABEDALRHMAN; BANSKOTA, SUHRID; HARRIS, CHRIS; LOVE, OLIVER P.; et al. The Circadian Clock Gene, Bmal1, Regulates Intestinal Stem Cell Signaling and Represses Tumor Initiation. CELLULAR AND MOLECULAR GASTROENTEROLOGY AND HEPATOLOGY, v. 12, n. 5, p. 1847-1872, . (19/04451-3)
ROSSELOT, ANDREW E.; PARK, MIRI; KIM, MARI; MATSU-URA, TORU; WU, GANG; FLORES, DANILO E.; SUBRAMANIAN, KRITHIKA R.; LEE, SUENGWON; SUNDARAM, NAMBIRAJAN; BRODA, TAYLOR R.; et al. Ontogeny and function of the circadian clock in intestinal organoids. EMBO Journal, v. 41, n. 2, . (19/04451-3, 17/16242-4)