Busca avançada
Ano de início
Entree

Metafundadores para predição genômica na raça Montana

Processo: 19/05516-1
Modalidade de apoio:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Data de Início da vigência: 10 de junho de 2019
Data de Término da vigência: 09 de março de 2020
Área de conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Fernando Sebastián Baldi Rey
Beneficiário:Sabrina Kluska
Supervisor: Daniela Andressa Lino Lourenço
Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
Instituição Anfitriã: University of Georgia, Athens (UGA), Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:17/21573-0 - Avaliação genômica em bovinos compostos da raça Montana utilizando dados reais e simulados, aplicando o método do passo único genômico BLUP, BP.DR
Assunto(s):Avaliação genética animal   Predição de genes   Melhoramento genético animal   Parâmetros genéticos   Montana
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:genomic evaluation | metafounders | multi-breed | ssGBLUP | Melhoramento dos Animais Domésticos

Resumo

A busca por metodologias capazes de aumentar a precisão da avaliação genética é constante. No entanto, para populações multirraciais, poucos são os estudos que usam o ssGBLUP e abordagens específicas para essas populações. O objetivo deste projeto de pesquisa é avaliar o impacto do uso de metafundadores na estimação de parâmetros genéticos, valores genéticos genômicos (GEBV), viés e acurácia do GEBV para populações multirraciais e método ssGBLUP. A base de dados é composta por informações fenotípicas de 514.165 animais de raça pura, cruzamentos e animais compostos (Montana). As características de peso ao nascimento(PN), peso à desmama (PD), ganho de peso pós-desmame (GPD) e circunferência escrotal aos 12 meses de idade (CE12)serão utilizadas. Um total de 1.899 animais foram genotipados usando três painéis diferentes com 30, 35 ou 770 mil marcadores SNPs. Posteriormente, todos esses genótipos foram imputados a um painel comercial Profiler (GGP) GeneSeek® da Illumina, contendo aproximadamente 30.000 marcadores SNPs. Análises de uni-características para todas as características descritas acima serão realizadas. Os métodos BLUP, ssGBLUP (BLUP de etapa única) e ssGBLUP + MFS (BLUP de etapa única + metafundadores) serão executados e, em seguida, esses modelos serão comparados entre si. Os resultados deste estudo devem mostrar as vantagens do uso de metafundadores, bem como a implementação do ssGBLUP em uma avaliação multirracial, a fim de aumentar a precisão das avaliações genéticas. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa:
Mais itensMenos itens
Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias ( ):
Mais itensMenos itens
VEICULO: TITULO (DATA)
VEICULO: TITULO (DATA)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
KLUSKA, SABRINA; MASUDA, YUTAKA; STERMAN FERRAZ, JOSE BENTO; TSURUTA, SHOGO; ELER, JOANIR PEREIRA; BALDI, FERNANDO; LOURENCO, DANIELA. Metafounders May Reduce Bias in Composite Cattle Genomic Predictions. FRONTIERS IN GENETICS, v. 12, . (19/05516-1)