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Filogenômica e caracterização genômica de algas vermelhas continentais da ordem Batrachospermales (Rhodophyta)

Processo: 23/00544-2
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Data de Início da vigência: 01 de março de 2023
Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2025
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Botânica - Taxonomia Vegetal
Pesquisador responsável:Orlando Necchi Junior
Beneficiário:Nadia Martins Lemes da Silva
Instituição Sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:20/11064-3 - Filogenômica e caracterização genômica de algas vermelhas continentais da ordem Batrachospermales (Rhodophyta), AP.R
Assunto(s):Algas vermelhas   Filogenia molecular   Filogenia   Genomas   Genômica
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Algas vermelhas | Filogenia molecular | Filogenômica | Genoma | Genoma organelar | Genômica | Ficologia (Algas)

Resumo

As informações atualmente disponíveis sobre a organização genômica das algas vermelhas de água doce da ordem Batrachospermales são esparsas e a classificação infraordinal de representantes desta ordem não está bem resolvida. O projeto propõe análise filogenômica e caracterização genômica de genomas plastidiais desse grupo de algas vermelhas. Os resultados gerados permitirão testar as seguintes hipóteses: 1) Os genomas de Batrachospermales serão altamente conservados, em concordância com outros membros de Florideophyceae em geral e mais particularmente de Nemaliophycidae; outras características devem ser encontradas, como genomas grandes e com um alto número de genes que codificam proteínas, ambos dentro da faixa relatada para Florideophyceae e mais semelhantes aos grupos mais próximos, como Nemaliales; 2) os dados atualmente disponíveis não permitem definir clados distintos dentro da ordem, razão pela qual apenas uma família é reconhecida no esquema atual; as análises filogenômicas revelarão dois ou mais grupos bem sustentados, que associados às características morfológicas vegetativas e reprodutivas, permitirão um novo e melhor rearranjo de gêneros e famílias; 3) a inclusão de maior número de táxons de Batrachospermales nas análises permitirá um melhor entendimento das relações filogenéticas entre as ordens Batrachospermales, Thoreales e Balbianiales dentro da subclasse Nemaliophycidae. Para testar essas hipóteses, os seguintes objetivos são propostos: (i) descrever as características dos genomas de plastídios de gêneros e espécies-chave da ordem e comparação com os genomas de outros grupos de algas vermelhas; ii) inferir as relações filogenéticas entre esses membros, de forma a esclarecer a classificação infraordinal; iii) aplicar os dados para levantar possíveis explicações para a transição dos habitats marinhos para os de água doce. O estudo proposto levanta aspectos de grande relevância: a) é uma ampla investigação de filogenômica e caracterização genômica do grupo mais representativo de rodófitas de água doce; 2) fornecerá informações valiosas para análises filogenômicas comparativas da ordem Batrachospermales com outros grupos de Rhodophyta, especialmente Nemaliophycidae; isso tornará possível refinar as relações filogenéticas dentro da subclasse; 3) fornecerá um bom conjunto de dados para uma avaliação mais geral sobre a transição de ambientes marinhos para de água doce para membros da ordem, bem como as possíveis relações com outras ordens exclusivamente de água doce com genomas já sequenciados (Balbianiales e Thoreales).

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