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Filogenômica e caracterização genômica de algas vermelhas continentais das ordens Batrachospermales e Thoreales (Rhodophyta)

Processo: 23/10342-8
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Programa Fixação de Jovens Doutores
Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2023
Data de Término da vigência: 31 de julho de 2025
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Botânica - Taxonomia Vegetal
Acordo de Cooperação: CNPq
Pesquisador responsável:Orlando Necchi Junior
Beneficiário:Monica Orlandi Paiano
Instituição Sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:23/01404-0 - Filogenômica e caracterização genômica de algas vermelhas continentais das ordens Batrachospermales e Thoreales (Rhodophyta), AP.R
Assunto(s):Algas vermelhas   Filogenia   Genomas   Algologia
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Algas vermelhas | Filogenômica | Genoma | Genoma organelar | genoma plastidial | Ficologia

Resumo

As informações atualmente disponíveis sobre a organização genômica das algas vermelhas de água doce das ordens Batrachospermales e Thoreales são esparsas e a relação filogenética entre estas ordens não está bem resolvida. O projeto propõe análise filogenômica e caracterização genômica de genomas plastidiais desses dois grupos de algas vermelhas. Os resultados gerados permitirão testar as seguintes hipóteses: 1) Os genomas plastidiais de Batrachospermales e Thoreales serão altamente conservados, em concordância com outros membros de Florideophyceae em geral e mais particularmente da subclasse Nemaliophycidae; outras características são esperadas, como genomas grandes e com um alto número de genes que codificam proteínas, ambos dentro da faixa relatada para Florideophyceae e mais semelhantes aos grupos mais próximos, como Nemaliales; 2) os dados atualmente disponíveis para membros da ordem Batrachospermales não permitem definir clados distintos dentro da ordem, razão pela qual apenas uma família é reconhecida no esquema atual; as análises filogenômicas revelarão dois ou mais grupos bem sustentados, que associados às características morfológicas vegetativas e reprodutivas, permitirão um novo e melhor rearranjo de gêneros e famílias; 3) a inclusão de maior número de táxons de Batrachospermales e Thoreales nas análises permitirá um melhor entendimento das relações filogenéticas entre as ordens exclusivamente de água doce (Batrachospermales, Thoreales e Balbianiales) dentro de Nemaliophycidae. O estudo proposto aborda aspectos de grande relevância: a) é uma ampla investigação de filogenômica e caracterização genômica dos dois grupos mais representativos de rodófitas de água doce; 2) fornecerá informações valiosas para análises filogenômicas comparativas das ordens Batrachospermales e Thoreales com outros grupos de Rhodophyta, especialmente Nemaliophycidae; isso tornará possível refinar as relações filogenéticas dentro da subclasse; 3) fornecerá um robusto e amplo conjunto de dados para uma avaliação mais geral sobre a transição de ambientes marinhos para de água doce para membros das duas ordens, bem como as possíveis relações com a outra ordem exclusivamente de água doce com genoma já sequenciado (Balbianiales).

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DA SILVA, NADIA M. LEMES; CROWELL, ROSEANNA M.; VIS, MORGAN I.; CHIASSON, WAYNE B.; PAIANO, MONICA O.; LOPES, YASMIN M. SILVA; NECCHI, ORLANDO JR.. Investigation of mitochondrial genomes of members of the order Batrachospermales (Rhodophyta). PHYCOLOGIA, v. N/A, p. 9-pg., . (22/12124-5, 23/10342-8, 23/00544-2)