O impacto da regulação genômica de ervas rasteiras Amazônicas na adaptação a um gradiente de inundação: questões-chave das alterações globais.

• Processo: 24/02205-3
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2024
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2026
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Clarisse Palma da Silva
• Beneficiário: Clarisse Palma da Silva
• Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 21/10639-5 - Centro de Pesquisa em Biodiversidade e Mudanças do Clima, AP.CEPID
• Bolsa(s) vinculada(s): 24/18110-1 - O impacto da regulação genômica em plantas Neotropicais adaptadas a gradientes de estresse ambiental: questões-chaves das alterações globais, BP.JD
• Assunto(s): Genômica comparativa Monocotiledôneas Neotrópico
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Elementos repetitivos | Evolução de plantas | genômica comparativa | Monocotiledôneas | Neotropico | RNAs não-codificantes | Genômica adaptativa e conservação, Genetica vegetal, Genetica da conservação

Resumo

Nas florestas ripárias da Amazônia, a distribuição das espécies é predominantemente influenciada pela sua tolerância à inundação. O gradiente de inundação molda os habitats e delineia tipos distintos de floresta úmida, criando refúgios hidrológicos vitais para plantas durante períodos de seca. Essas áreas também enfrentam perturbações devido às mudanças climáticas. Ischnosiphon puberulus, pertencente à família Marantaceae, ocorre em diferentes ambientes das florestas inundáveis da zona ripária do rio Cupari, na Amazônia brasileira. Estudos evolutivos com base na variação intraespecífica são cruciais para compreender processos de diversificação biológica e para desenvolver estratégias de conservação diante das mudanças climáticas. O avanço das tecnologias de sequenciamento em larga escala tem possibilitado uma melhor compreensão desses processos, permitindo o acesso à diversidade genômica presente em uma espécie. A equipe sequenciou e montou o genoma de referência para a espécie, e obteve transcriptoma de 41 indivíduos de ocorrência natural, em dois tipos distintos de florestas em áreas úmidas amazônicas: Floresta de Igapó, sujeita a pulsos de inundação monomodais previsíveis e duradouros, e florestas de Terra Firme, com pulsos de inundação polimodais curtos e imprevisíveis. Assim, este projeto tem o objetivo de acessar a diversidade genômica intraespecífica de Ischnosiphon puberulus nos ambientes inundados para compreender processos de adaptação e evolução dessa espécie. Os dados serão utilizados para identificar genes relacionados à adaptabilidade a essas condições contrastantes. Além disso, os elementos repetitivos (REs) do genoma e os RNAs longos não-codificantes (lncRNAs), serão anotados para avaliar seu impacto na regulação genômica, visto que sua expressão pode ser altamente variável entre indivíduos da mesma espécie, com objetivo de estudar sua variação e regulação em populações naturais. Espera-se que esses estudos contribuam para uma compreensão mais profunda dos processos de diversificação, e assim possam auxiliar na formulação de estratégias de conservação e manejo dentro desse contexto de ambiente sujeito a inundações. (AU)