Simulador de cálculo de coeficiente de partição de moléculas orgânicas

• Processo: 05/05218-8
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2006
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2009
• Área do conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Sistemas de Computação
• Pesquisador responsável: Andréa Lucia Braga Vieira Rodrigues
• Beneficiário: Andréa Lucia Braga Vieira Rodrigues
• Instituição Sede: Pró-Reitoria de Pós-Graduação e Pesquisa. Universidade de Sorocaba (UNISO). Sorocaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Interface gráfica Algoritmos e estruturas de dados Algoritmos para processamento
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Algoritmo | Calculos Fisico Quimicos | Coeficiente De Particao | Interface Grafica | Simulador | Web | Cálculos Físico-Químicos de Propriedade Molecular

Resumo

Coeficiente de partição (CP) de um fármaco é uma medida quantitativa que fornece informações à respeito da sua polaridade e, em muitos casos, dita sua distribuição nos diferentes espaços biológicos do corpo humano. Quando um fármaco é submetido a um sistema binário de solventes (n-octanol/água) ele se distribui caracteristicamente entre as duas fases e seu CP é calculado dividindo-se a concentração deste na fase n-octanol por sua concentração na fase aquosa, assim quanto maior for o valor do CP, mais lipofílico ele será. O CP pode ser determinado por três diferentes métodos: empiricamente pelo método shake flask (SF), por cromatografia líquida de alta eficiência (CLAE) ou através de cálculos. O escopo deste trabalho é criar uma ferramenta capaz de processar estes cálculos para diferentes moléculas orgânicas a partir de métodos adequados em termos de capacidade preditiva, ou seja, aqueles que mais aproximem os valores calculados dos empíricos. Os métodos de cálculo de CP se baseiam na fragmentação da molécula em sub-unidades que possuam valores de CP confiáveis e incluindo-se os termos de correção devidos às interações intramoleculares. Assim, para automatizar o cálculo de CP será adotado o método consagrado de Rekker e será implementado um sistema que, a partir de um algoritmo representando a fórmula estrutural da molécula, processe seu cálculo de CP buscando, no banco de dados as contribuições dos fragmentos e os termos de correção. O método computacional permite estudos de centenas de moléculas, o que possibilitará, futuramente, corrigir os desvios e re-dimensionar os cálculos para otimizar sua característica preditiva. (AU)