Nematóides e bactérias - abordagem genômica a um modelo experimental de interação parasita-hospedeiro

• Processo: 10/51973-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2011
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2013
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Carlos Eduardo Winter
• Beneficiário: Carlos Eduardo Winter
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 12/20945-7 - Análise Bioinformática do Genoma de Photorabdus luminescens MN7, BP.TT
• Assunto(s): Genômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Caenorhabditis Elegans | Genomica | Heterorhabditis | Photorhabdus | Vitelogenina

Resumo

Os nematoides entomopatogênicos (NEPs) vivem em simbiose com enterobactérias específicas. NEPs são utilizados já há algumas décadas para controle de pragas agrícolas nos Estados Unidos e Europa. As bactérias do gênero Photorhabdus são os simbiontes de NEPs do gênero Heterorhabditis. Recentemente Heterorhabditis bacteriophora e seu simbionte, Photorhabdus luminescens subsp. laumondii, foram considerados modelos para o estudo de interações patógeno-hospedeiro. O genoma de P. luminescens subsp. laumondii TT01 foi completamente seqüenciado e mostrou um número acima do esperado de genes que codificam enzimas envolvidas na produção de metabólitos secundários. O nosso laboratório tem como uma de suas linhas de pesquisa o estudo de aspectos moleculares de isolados brasileiros de NEPs e suas bactérias simbiontes. Linhagens de duas espécies de Heterorhabditis (H. baujardi e H. indica), obtidas da região amazônica, foram caracterizadas molecularmente por nós. As bactérias de uma das linhagens de H. baujardi (LPP7) foram crescidas isoladamente. Análise filogenética da seqüência do rRNA 16 S deste isolado (denominado MN7) mostra que ele pode fazer parte do mesmo ciado de P. asymbiotica, uma espécie isolada de feridas em seres humanos, na Austrália e Estados Unidos. Dados recentes de nosso laboratório mostraram que MN7 secreta metabólitos secundários de interesse biotecnológico, além de uma protease semelhante à detectada em outras espécies do gênero. Assim, estamos propondo neste projeto a construção de um esqueleto ("scaffold") do genoma de Photorhabdus sp. MN7, através de "next generation sequencing" (NGS). O presente projeto tem por finalidade entender melhor a biologia e evolução das bactérias do gênero Photorhabdus e fazer um inventário, o mais completo possível, dos genes envolvidos na produção de metabólitos secundários e toxinas que medeiam as relações simbióticas com o nematóide e patogênicas com o inseto e outras espécies de nematóides. Este projeto estará integrado com outros projetos do laboratório que estudam nematóides entomopatogênicos ou suas bactérias e gerará dados importantes para pesquisadores que trabalham com essas bactérias em outros países. (AU)