Análise da expressão de RNAs intrônicos não-codificantes em linhagens celulares e tecidos tumorais humanos utilizando hibridização "in situ"

• Processo: 06/56919-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2007
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2011
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Eduardo Moraes Rego Reis
• Beneficiário: Ana Carolina Ayupe de Oliveira Beckedorff
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 02/13283-6 - Identificação de marcadores moleculares para diagnóstico e prognóstico em câncer utilizando microarrays de DNA, AP.TEM
• Assunto(s): Expressão gênica Hibridização in situ Linhagem celular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cancer | Expressao Genica | Hibridizacao In Situ | Linhagens Celulares

Resumo

Trabalhos recentes têm revelado que uma fração significativa do transcritoma dos organismos superiores é composto por RNAs não codificantes, que incluem novas classes de RNAs que possuem função regulatória na expressão gênica em situações normais e patológicas. Nosso grupo tem caracterizado uma nova classe de RNAs composta por fragmentos intrônicos longos, expressos em orientação antisenso ao mRNA codifícante para proteína expresso na direção oposta, e cuja abundância está correlacionada com o grau de malignidade de tumores de próstata (Reis et al.,2004). Para avançar na caracterização da expressão de RNAs intrônicos não-codificantes em tecidos humanos, pretende-se neste trabalho estudar a expressão dessas mensagens intrônicas em linhagens celulares e em cortes histológicos de tecidos normais e tumorais frescos através de hibridização in situ com sondas de RNA. Essa abordagem possibilitará a obtenção de informações a respeito da localização sub-celular dos transcritos intrônicos, o que será de grande importância para o melhor entendimento da biogênese desses RNAs assim como dos possíveis mecanismos regulatórios em que participam. Espera-se também que os experimentos de hibridização in situ permitam a obtenção de medidas quantitativas relativas à abundância dessas mensagens nas células e-tecidos, complementando assim a informação obtida pela análise dos microarrays de expressão. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

BECKEDORFF, Ana Carolina Ayupe de Oliveira. Biogênese, estabilidade e localização sub-celular de RNAs não-codificadores longos expressos em regiões intrônicas do genoma humano. 2012. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Conjunto das Químicas (IQ e FCF) (CQ/DBDCQ) São Paulo.