Estruturação de um banco de amostras biológicas de pacientes com toc e controles-bioprotoc

• Processo: 10/14877-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2010
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2011
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Eurípedes Constantino Miguel Filho
• Beneficiário: Daniel Bracher Mariani
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 05/55628-8 - Caracterização fenotípica, genética, imunológica e neurobiológica do transtorno obsessivo-compulsivo e suas implicações para o tratamento, AP.TEM
• Assunto(s): Biologia computacional Transtorno obsessivo-compulsivo Banco de dados
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Banco de dados | bioinformática | genética | Tic | Toc | Tourrete | Organização de Banco de Dados de DNA

Resumo

Um dos fatores limitantes para a realização de estudos genéticos é a necessidade de obter informação de muitos pacientes que garantam poder amostral suficiente para a confirmação das hipóteses geradas pelos métodos atuais de análise genética. Uma forma de minimizar estas limitações são os projetos colaborativos. Recentemente vários grupos tem se unido e criado os consórcios de estudos genéticos das doenças mentais. Os principais trabalhos gerados são os estudos de associação do genoma inteiro. Para isto é cada vez mais necessário garantir a qualidade s informações geradas. Alem das informações fenotípicas, é necessário garantir a qualidade do material biológico. O objetivo deste projeto é desenvolver e implantar uma interface moderna e eficiente para inserir, armazenar, organizar e interligar tanto os dados laboratoriais, bem como os dados fenotípicos do individuo do qual a amostra é proveniente o que irá garantir um controle de qualidade e uma maior eficiência dos trabalhos de genética do grupo Programa do Espectro do Transtorno Obsessivo-Compulsivo (PROTOC). O banco de amostras biológicas de pacientes com TOC e controles armazenará as informações referentes a projetos da área da genética vinculados ao PROTOC como de outros grupos de pesquisa que já colaboram e que por ventura venham a ter interesse em colaborar conosco. Esse banco de dados será construído a partir da plataforma do programa PROGENY®, largamente utilizado em centros de pesquisa de ponta ao redor do mundo. Além do desenvolvimento do banco de dados, o programa PROGENY® também permitirá exportação dos dados armazenados para análise genética em programas largamente utilizados com este propósito, tais como o HAPLOVIEW, PHASE e PLINK. Para tal, será realizado um treinamento técnico para utilização dessa ferramenta visando à construção de uma plataforma que melhor atenda as necessidades dos nossos estudos atuais e futuros. Em uma última etapa do projeto será elaborado meios de integração dos dados armazenados no PROGENY® com bancos de dados públicos, visando à integração de dados com outras Universidades do Brasil e do mundo.