Perfis de energia livre para nanotubos peptídicos em água

• Processo: 11/03249-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2011
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2013
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Física - Física da Matéria Condensada
• Pesquisador responsável: Eudes Eterno Fileti
• Beneficiário: Ygor Morais Jaques
• Instituição Sede: Centro de Ciências Naturais e Humanas (CCNH). Universidade Federal do ABC (UFABC). Ministério da Educação (Brasil). Santo André , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 12/03211-0 - Dinâmica molecular atomística e coarse grained de nanotubos peptídicos lineares, BE.EP.MS
• Assunto(s): Termodinâmica química Simulação de dinâmica molecular Nanotubos de peptídeos Simulação por computador
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Dinâmica Molecular | Energia Livre | Nanotubo de peptídeo | Pmf | Simulação Computacional | Umbrella sampling | Termodinâmica Química

Resumo

Dos diversos tipos de nanotubos existentes, aqueles baseados em peptídeos tem atraído ampla atenção na comunidade científica, uma vez que os segmentos peptídicos possuem alto potencial de auto-montagem, além de possibilitar a adição de funcionalidades específicas em certas posições do nanotubo favorecendo sua alta biocompatibilidade. Neste sentido, a capacidade intrínseca de auto-montagem apresentadas por algumas sequências de peptídeos favorece a formação de geometrias tubulares. Este projeto prevê o uso de simulações computacionais, visando o estudo de tais nanotubos em solução aquosa. Enfoque principal será dado a determinação da energia livre associada a processos físico-químicos importantes que ocorrem em meio líquido, tais como a hidratação, dimerização e agregação hidrofóbica. Complementarmente, propriedades estruturais e dinâmicas dos sistemas tratados também serão examinadas. Tal estudo será realizado através de simulações atomísticas de dinâmica molecular. (AU)