Acurácia da seleção genômica na predição de híbridos simples de milho tropical obtidos via diferentes delineamentos genéticos

• Processo: 15/26251-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Pesquisa
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2016
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2017
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia
• Pesquisador responsável: Roberto Fritsche Neto
• Beneficiário: Roberto Fritsche Neto
• Pesquisador Anfitrião: Jean-Luc Jannink
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Cornell University, Estados Unidos
• Assunto(s): Melhoramento genético vegetal Modelos lineares mistos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Dialelos | grupos heteróticos | modelos mistos | Seleção Genômica Ampla | testecrosses | Melhoramento vegetal

Resumo

A maior dificuldade no melhoramento de milho e obter e avaliar de todas as possíveis combinações híbridas (dialelo completo). Para reduzir esta dificuldade, diversos delineamentos genéticos foram propostos, como o dialelo parcial, o circulante e o testcross. Estes delineamentos podem apresentar grandes diferenças nas estimativas dos componentes de variância e no valor genético dos genitores superiores, devido principalmente aos seus princípios de representatividade dos cruzamentos e grupos heteróticos. Com o advento da Seleção Genômica (GS) tornou-se possível predizer, com certa acurácia, o comportamento de indivíduos não avaliados a campo. No entanto, ainda não foi definido o melhor delineamento genético para a formação da população de treinamento, o qual seja capaz de equilibrar custos, facilidade na sua formação e acurácia seletiva. Diante do exposto, o objetivo deste projeto é avaliar a acurácia da GS na predição de híbridos simples de milho tropical obtidos via diferentes delineamentos genéticos e identificar qual possui a melhor relação custo beneficio. Para isso, quatro diferentes tipos populações de treinamento serão considerados, derivadas a partir de um dialelo completo: dialelo completo, parcial, circulante e testecross. Tais delineamentos foram obtidos a partir da hibridação de 224 linhagens endogâmicas, as quais foram cruzadas de forma diferencial de acordo com o delineamento. Com isto, foram obtidos aproximadamente 3.000 híbridos simples. A genotipagem das linhagens será realizada usando marcadores do tipo SNP, obtidos via Genotyping by Sequencing (GBS), na Universidade de Cornell, USA. Os dados fenotípicos dos híbridos estão sendo obtidos, em parceria da ESALQ-SP com a Empresa Hélix Sementes, em experimentos realizados a campo, em cinco locais no Brasil, por dois anos e duas épocas de cultivo (safra e safrinha). De posse dos dados fenotípicos e genotípicos, serão realizadas as análises dos dados via equações modelos mistos. Esta etapa também será realizada no Centro de Genética e Melhoramento de Plantas, da Universidade de Cornell, com colaboração do Prof. Dr. Jean-Luc Jannink.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

FRISTCHE-NETO, ROBERTO; AKDEMIR, DENIZ; JANNINK, JEAN-LUC. Accuracy of genomic selection to predict maize single-crosses obtained through different mating designs. THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, v. 131, n. 5, p. 1153-1162, MAY 2018. (15/26251-5, 13/24135-2)