Modelagem metabólica da produção de poli-hidroxialcanoatos com diferentes composições monoméricas por Pseudomonas sp.

• Processo: 16/01756-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2016
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2019
• Área de conhecimento: Engenharias - Engenharia Química
• Pesquisador responsável: Marilda Keico Taciro
• Beneficiário: Rafael Augusto Theodoro Pereira de Souza Nahat
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 18/05456-6 - Um modelo metabólico em escala genômica preditivo para Pseudomonas sp. LFM046, BE.EP.DD
• Assunto(s): Engenharia metabólica Bioprocessos Poli-hidroxialcanoatos Pseudomonas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Framework de modelagem metabólica | Otimização de Bioprocessos | Polihidroxialcanoatos (PHA) | Pseudomonas | Engenharia metabólica para bioprocessos

Resumo

Este plano de trabalho propõe desenvolver um framework de modelagem metabólica e com ele construir e validar um modelo metabólico preditivo de Pseudomonas sp. para a produção de poli-hidroxialcanoatos (PHA), considerando o controle de sua composição monomérica. A escolha deste caso de estudo se deve a: existência duma extensa base de conhecimento já disponível, com dados de mais de 40 quimiostatos; e apelo industrial do PHA, um polímero biocompatível, biodegradável e com um grande leque de propriedades físico-químicas devido à existência de mais de 150 monômeros diferentes. O modelo está sendo construído tendo como base o genoma sequenciado da linhagem Pseudomonas sp. LFM046. Uma vez validado, o modelo passará por 3 baterias de testes: estender a validação de cada fenótipo observado de 1 vetor para um subespaço vetorial; procurar padrões na topologia da rede metabólica; e fazer análises de sensibilidade para descobrir oportunidades de otimização do bioprocesso, que serão testadas in silico e, se necessário, in vivo. Já foi desenvolvida a metodologia para tratamento e refinamento de dados existentes de quimiostato e partes das metodologias das baterias de testes. Essas metodologias e o framework serão transferíveis a outros sistemas biológicos e bioprodutos, acelerando futuros ciclos de P&D. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

NAHAT, Rafael Augusto Theodoro Pereira de Souza. Modelagem metabólica da produção de polihidroxialcanoatos com diferentes composições monoméricas por Pseudomonas sp.. 2019. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Ciências Biomédicas (ICB/SDI) São Paulo.