Desenvolvimento de modelo geométrico dos cromossomos levando em conta mapas HiC

• Processo: 21/04275-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2021
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2022
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Física
• Pesquisador responsável: Mario Antonio Bernal Rodriguez
• Beneficiário: Carolina Arnosti
• Instituição Sede: Instituto de Física Gleb Wataghin (IFGW). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 18/15316-7 - Estudo da interação de partículas carregadas pesadas com o DNA usando métodos computacionais, AP.JP2
• Assunto(s): Biofísica DNA Cromossomos Cromatina Controle geométrico
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: cromossomos | Dna | Hi-C maps | modelo geométrico | Biofísica

Resumo

A interação de partículas ionizantes com o DNA pode produzir danos biológicos, incluindo o câncer. Esse processo pode ser estudado com modelos baseados em simulações Monte Carlo (MC). Para isto, precisamos de modelos geométricos do material genético humano, levando em conta desde os pares de nucleotídeos até os cromossomos. Os mapas HiC permitem determinar experimentalmente os pontos de contatos da fibra de cromatina com si própria dentro de cada cromossomo e inter-cromossomo. Nosso grupo está trabalhando na conversão destes mapas em estruturas tridimensionais dos cromossomos. Está faltando completar essas estruturas com nosso modelo atômico da cromatina de 30 nm.