Filogenômica e caracterização genômica de algas vermelhas continentais da ordem Batrachospermales (Rhodophyta)

• Processo: 22/07658-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2022
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2023
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Botânica - Taxonomia Vegetal
• Pesquisador responsável: Orlando Necchi Junior
• Beneficiário: Yasmin Maria da Silva Lopes
• Instituição Sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 20/11064-3 - Filogenômica e caracterização genômica de algas vermelhas continentais da ordem Batrachospermales (Rhodophyta), AP.R
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: freshwater algae | Molecular phylogeny | organelle genomes | phylogenomics | plastomes | red algae | Sistemática e filogenia de algas vermelhas

Resumo

Informações atualmente disponíveis sobre a organização genômica das algas vermelhas de água doce da ordem Batrachospermales é esparsa e a classificação infra-ordinal de representantes desta ordem não está bem resolvido. O projeto propõe filogenômica análise e caracterização genômica de genomas de plastídios desse grupo de algas vermelhas. Os resultados gerados permitirão testar as seguintes hipóteses: 1) Batrachospermales genomas serão altamente conservados, de acordo com outros membros da Florideophyceae em geral e mais particularmente de Nemaliophycidae; outras características deveriam serencontrados, como grandes genomas com um alto número de genes que codificam proteínas, ambos dentro o intervalo relatado para Florideophyceae e mais semelhante aos grupos mais próximos, como Nemaliales; 2) os dados atualmente disponíveis não permitem definir clados distintos dentro do pedido, razão pela qual apenas uma família é reconhecida no esquema atual; análises filogenômicas irão revelar dois ou mais grupos bem apoiados, que associados com características morfológicas vegetativas e reprodutivas, permitirá um novo e melhor rearranjo de gêneros e famílias; 3) a inclusão de maior número de táxons de batrachospermales nas análises permitirão um melhor entendimento da relações filogenéticas entre as ordens Batrachospermales, Thoreales e Balbianiales dentro da subclasse Nemaliophycidae. Para testar essas hipóteses, o os seguintes objetivos são propostos: (i) descrever as características dos genomas de plastídios de gêneros e espécies chave em ordem e comparação com os genomas de outras algas vermelhas grupos; ii) inferir as relações filogenéticas entre esses membros, a fim de esclarecer a classificação infra-ordinária; iii) aplicar os dados para levantar possíveis explicações para a transição de habitats marinhos para de água doce. O estudo proposto levanta aspectos de grande relevância: a) É uma ampla investigação de filogenômica e caracterização genómica do grupo mais representativo de rodófitas de água doce; 2) fornecerá valiosos "insights" para análises filogenômicas comparativas da ordem Batrachospermales com outros grupos de Rhodophyta, especialmente Nemaliophycidae; isso tornará possívelrefinar as relações filogenéticas dentro da subclasse; 3) fornecerá um bom conjunto de dados para avaliação mais geral sobre a transição de ambientes marinhos para ambientes de água doce para membros da ordem, bem como as possíveis relações com outros exclusivamente ordens de água doce com genomas já sequenciados (Balbianiales e Thoreales).