Predições indiretas com base na avaliação genômica de populações cebuinas multirraciais usando o método de etapa única GBLUP com metafundadores

• Processo: 22/15168-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 05 de março de 2023
• Data de Término da vigência: 04 de março de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Fernando Sebastián Baldi Rey
• Beneficiário: Marisol Londoño Gil
• Supervisor: Daniela Andressa Lino Lourenço
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of Georgia, Athens (UGA), Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 20/14275-5 - Estratégias para predição genômica em populações multirraciais de zebuínos aplicando o método do passo único genômico BLUP, BP.DR
• Assunto(s): Pecuária de corte Genômica Predição genômica Avaliação genética animal
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Beef cattle | direct genomic value | genomic relationships | Genomic selection | metafounders | prediction ability | Genômica

Resumo

O objetivo deste projeto de pesquisa é obter predições indiretas de animais genotipados das raças Brahman, Guzerá e Tabapuã por meio de uma avaliação genética multirracial que inclua também a raça Nelore. Para isso, serão utilizadas informações fenotípicas e de pedigree dos programas de melhoramento das quatro raças, da Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP), Ribeirão Preto, SP. Serão utilizadas informações fenotípicas de peso ajustado aos 210 (P210) e 450 (P450) dias de idade e circunferência escrotal aos 365 dias de idade (C365). Para a raça Nelore, serão utilizados registros de 1.443.729, 1.237.339 e 443.044 animais para P210, P450 e C365, respectivamente, distribuídos em 294 rebanhos. Para a raça Brahman, o banco de dados será composto por 81.414, 40.655 e 16.478 registros para P210, P450 e C365, respectivamente, distribuídos em 35 rebanhos. Para a raça Guzerá, serão utilizados 26.261, 21.747 e 7.137 registros para P210, P450 e C365, respectivamente, distribuídos em 25 rebanhos. Por fim, para a raça Tabapuã, serão utilizados 9.943, 6.695 e 2.178 registros para P210, P450 e C365, respectivamente. Dados genotípicos de 38.586, 3.102, 1.389 e 427 animais das raças Nelore, Brahman, Guzerá e Tabapuã, respectivamente. Será empregado o chip ZBN Zoetis com 74.653 SNPs. Serão realizadas análises intrarraciais e multirraciais para as três características, com base na metodologia ssGBLUP (single breed) ou usando a metodologia metafounders (ssGBLUP + MF) para o multirracial. Serão obtidas predições indiretas (valor genômico direto - DGV) para os animais genotipados (jovens) das raças pequenas com registros, mas não progênie, através de uma função linear de efeitos e conteúdos SNP usando uma população multirracial, Nelore ou dentro da referência. A capacidade preditiva será calculada como a correlação entre DGV e os fenótipos ajustados para efeitos fixos (Y*) ou o GEBV estimado usando ou não MF com todos os conjuntos de dados (intra ou multirracial), a fim de avaliar o impacto de avaliação multirracial e MF em predições genéticas para crescimento e características reprodutivas. (AU)