Predição genômica para características indicadoras de precocidade sexual e longevidade utilizando informações de Metafundadores através do Método Passo Único Genômico BLUP na raça Nelore

• Processo: 22/12134-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2023
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Fernando Sebastián Baldi Rey
• Beneficiário: Larissa Bordin Temp
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 23/08817-8 - Aplicação da matriz genômica ponderada na predição do desempenho reprodutivo em bovinos Nelore, BE.EP.MS
• Assunto(s): Bos taurus indicus Características reprodutivas Parâmetros genéticos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bos taurus indicus | Características reprodutivas | habilidade de predição | metafundadores | parâmetros genéticos | Seleçãoo Genômica | Avaliações genômicas

Resumo

Este projeto de pesquisa, tem por objetivo avaliar o efeito da utilização de um ou vários metafundadores e de pedigree ausente nas estimativas dos componentes de (co) variância, acurácia e viés de predição dos valores genômicos utilizando o método do passo único genômico BLUP para características relacionadas a precocidade sexual, fertilidade e longevidade em bovinos da raça Nelore. Serão utilizadas informações fenotípicas e genotípicas do programa de melhoramento Nelore Brasil para as características perímetro escrotal ao ano (PE365), idade a puberdade de machos (IPM), probabilidade de parto precoce aos 24 (PP24) e 30 meses de idade (PP30) e stayability aos 48 (STAY 48) e 72 meses de idade (STAY 72) com aproximadamente 414.000, 25.000, 200.000 e 500.000 observações fenotípicas, respectivamente. Serão realizadas análises unicaracterística com base BLUP, genômica sem metafundadores (ssGBLUP) e genômica com uso de metafundadores (ssGBLUP+MF). Os metafundadores adotados serão relacionados por uma matriz de relações aditivas A() dada por uma matriz positiva definida que pode ser invertida . Diferentes números de metafundadores serão testados. Os métodos utilizados serão comparados baseando-se na acurácia e no viés de predição dos valores genômicos para PE365, IPM, PP24, PP30, STAY 48 e STAY 72 obtidos pelo método LR (regressão linear). Através deste projeto será possível determinar como a inclusão de metafundadores afeta a habilidade de predição, acurácia e viés das avaliações genômicas, bem como, recomendações do seu uso em trabalhos futuros utilizando informações genômicas na raça Nelore.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

TEMP, LARISSA BORDIN; BRUNES, LUDMILLA COSTA; PEREIRA, LETICIA SILVA; AMORIM, SABRINA THAISE; LOBO, RAYSILDO BARBOSA; DE BRITO, OVIDIO CARLOS; VIACAVA, RICARDO; BALDI, FERNANDO. Effect of genetic and sex effect on genomic prediction for horn development in Nellore cattle. LIVESTOCK SCIENCE, v. 284, p. 7-pg., 2024-05-22. (22/12134-0)