Entendendo o papel das reticulações nas interrelações das ordens de Ostariophysi usando redes filogeneticas.

• Processo: 23/07838-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2023
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Claudio de Oliveira
• Beneficiário: Gustavo Adolfo Ballen Chaparro
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 20/13433-6 - Filogenia e identificação molecular de peixes da superordem Ostariophysi (Chordata: Actinopterygii) utilizando abordagens genômicas, AP.TEM
• Assunto(s): Biologia computacional Characiformes Filogenia Siluriformes Ictiologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformatics | characiformes | Ichthyology | Phylogenetic networks | Phylogeny | siluriformes | Ictiologia

Resumo

A superordem Ostariophysi é o maior clado de peixes estritamente de água doce no mundo. A sua diversidade tem sido arranjada em cinco ordens, cujas interrelações tem se mostrado problemáticas em diferentes estudos usando variadas fontes de dados. Enquanto conjuntos de dados de escala genômica são disponibilizados, tem sido encontrado uma falta de consenso entre estudos sobre questões básicas tais como as interrelações interordinais, a monofilia de algumas ordens (e.g.,Characiformes), as interrelações basais em alguams das ordens, em particular em Siluriformes, Gymnotiformes,e Characiformes. O uso de metodos para inferência de redes filogeneticas tem sido usado raras vezes em ictiologia neotropical, porém tendo o potencial de explicar complexas questões topologicas que provém da presença de discordância entre árvores de genes e áUvores de especies, incomplete lineage sorting, ou então reticulações de natureza pontual(hibridização) ou de longo prazo. Um dos desafios para tentar responder essas questões são a grande diversidade do grupo que contém milhares de espécies. A geração de dados moleculares de escala genômica leva então a um segundo desafio, que é a dificuldade em desenvolver e aplicar metodos para a análise desses grandes conjuntos de dados. Propo-mos aqui a análise de um enorme conjunto de dados para este grupo supraordinal de peixes, também como o desenvolvimento de ferramentas para facilitar a análise de dados e a inferência de redes filogenéticas que possam nos ajudar a compreender a complexa história evolutiva dos Ostariophysi.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

BALLEN, GUSTAVO A.; DE PINNA, MARIO C. C.. A reply to a comment on Ballen and de Pinna (2021) by Kubicek, Britz, and Conway. ZOOLOGICAL JOURNAL OF THE LINNEAN SOCIETY, v. N/A, p. 3-pg., 2024-04-11. (16/02253-1, 23/07838-1, 14/11558-5)

PRZELOMSKA, NATALIA A. S.; DIAZ, RUDY A.; AVILA, FABIO ANDRES; BALLEN, GUSTAVO A.; CORTES-B, ROCIO; KISTLER, LOGAN; CHITWOOD, DANIEL H.; CHARITONIDOU, MARTHA; RENNER, SUSANNE S.; PEREZ-ESCOBAR, OSCAR A.; et al. Morphometrics and Phylogenomics of Coca (Erythroxylum spp.) Illuminate Its Reticulate Evolution, With Implications for Taxonomy. Molecular Biology and Evolution, v. 41, n. 7, p. 19-pg., 2024-07-10. (23/07838-1)

DE GRACIA, CARLOS; VILLALOBOS-SEGURA, EDUARDO; BALLEN, GUSTAVO A.; CARNEVALE, GIORGIO; KRIWET, JUERGEN. Phylogenetic patterns in fossil and living billfishes (Istiophoriformes, Istiophoridae): evidence from the Central Mediterranean. PAPERS IN PALAEONTOLOGY, v. 10, n. 4, p. 27-pg., 2024-07-01. (16/02253-1, 23/07838-1, 14/11558-5)