Identificação de módulos de co-expressão proteica associados a células-tronco hematopoiéticas de potencial de enxertia de longa duração (LT-HSC) em populações frescas

• Processo: 23/17841-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2024
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Karina Griesi Oliveira
• Beneficiário: João Pedro Pereira Poit
• Instituição Sede: Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein (IIEPAE). Sociedade Beneficente Israelita Brasileira Albert Einstein (SBIBAE). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 22/03118-1 - Identificação e avaliação de assinatura de expressão gênica de células-tronco hematopoiéticas por abordagens de biologia de sistemas e aprendizado de máquina, AP.PNGP.PI
• Assunto(s): Aprendizado computacional Células-tronco hematopoéticas Proteômica Transcriptômica Expressão gênica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: aprendizado de máquinas | Celulas-Tronco Hematopoieticas | proteômica | Transcriptômica | Wgcna | Expressão gênica

Resumo

Em vista da importância funcional das células-tronco hematopoiéticas de potencial de enxertia de longa duração (LT-HSC) para reconstituição medular, seja em contextos de transplantes alogênicos ou autólogos (como em aplicações recentes de terapia gênica), e de sua baixa frequência dentre as células hematopoiéticas, ainda há muitos esforços para otimizar condições de manipulação e expansão ex vivo desta população celular. A validade de marcadores de superfície de enriquecimento para LT-HSC cultivadas em diferentes condições ainda é incerta, e por isso, a demonstração da presença destas células ainda precisa ser realizada por meio de xenotransplante em camundongos a cada nova tentativa de otimização de protocolo, uma estratégia laboriosa e demorada. Assim, o delineamento de ferramentas para a avaliação prospectiva de abundância de LT-HSC cultivadas por estratégias que possam se mostrar mais robustas, comparativamente ao uso de marcadores superfície celular, e de mais simples execução, se faz extremamente importante pois pode facilitar os testes de otimização de condições de cultivo de HSC visando a manutenção de sua potencialidade. Neste sentido, é de crucial importância que se compreenda em profundidade quais são os grupos de genes que agem de forma conjunta para determinar esse fenótipo celular. A análise dessa questão no nível de proteômica e com uma abordagem sistêmica de análise trata-se de uma contribuição inédita para a literatura que pode trazer uma compreensão mais aprofundada sobre quais genes poderiam representar os marcadores ideais desta população celular.