Caracterização funcional de micovírus presentes em fungos fitopatogênicos e seu papel nas interações multitróficas

• Processo: 24/10439-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2024
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2028
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Márcio de Castro Silva Filho
• Beneficiário: Israel Felipe Gonçalves Soares
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Micovírus
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: caracterização morfofisiológica | Colletotrichum falcatum | dsRNA | Fusarium verticillioides | Micovírus | Transcripitoma | Interações Multitróficas

Resumo

Os fungos fitopatogênicos Fusarium verticillioides e Colletotrichum falcatum associados a broca Diatraea saccharalis são responsáveis pela ocorrência do complexo da podridão vermelha da cana de cana-de-açúcar (Saccharum officinarum). Recentemente, nosso grupo mostrou a ocorrência de micovírus de RNA fita dupla que podem causar efeitos significativos em seu hospedeiro. Dessa forma, este trabalho tem como objetivo, avaliar as alterações fenotípicas e moleculares nos fungos fitopatogênicos F. verticillioides ESALQ e C. falcatum MMBF 01/18 infectados pelos micovírus de genoma de dsRNA Fusarium verticillioides partitivirus 1 e Coletotrichum falcatum victorivirus 1, respectivamente. Para isto, linhagens isogênicas dos fungos infectados e não infectados por micovírus serão cultivadas em meio de Batata dextrose (BDA) e serão realizados experimentos para avaliar suas características morfofisiológicas: morfologia da colônia (coloração), morfologia da hifa, capacidade de esporulação, velocidade de crescimento micelial, comprimento dos conídios, largura dos conídios e efeitos da infecção viral na resposta a estresses abióticos (temperaturas, salinidade e fonte de carbono). Além disso, para identificar as alterações moleculares decorrente da infecção fúngica, será realizado extração de RNA total com RNeasy® Plant Mini Kit (Qiagen) e avaliados o transcripitoma por meio do sequenciamento Illumina. Os dados limpos e qualificados de cada amostra serão mapeados para as transcrições genéticas anotadas do genoma de referência usando o software Bowtie 2. Para uma análise abrangente do transcriptoma buscando elucidar a base molecular dessa interação, serão realizadas as contagens de leitura normalizadas pela biblioteca DESeq implementada no software R.