Atualização da plataforma SUCEST-FUN para integração de ômicas

• Processo: 25/10513-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2025
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2027
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Sistemas de Computação
• Pesquisador responsável: Glaucia Mendes Souza
• Beneficiário: Nany Kuzola Huna Paulo António
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 22/11460-1 - Genômica e biotecnologia para o aumento da produtividade, resiliência a climas futuros e bioprodutos de cana, AP.TEM
• Assunto(s): Banco de dados Biologia computacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Banco de dados | bioinformática | Plataforma Web | Banco de dados

Resumo

O banco de dados SUCEST-FUN (http://sucest-fun.org/) é gerenciado a partir de uma série de ferramentas mantidas pelo Laboratório de Transdução de Sinais do Instituto de Química da Universidade de São Paulo-USP. Com a obtenção de um novo servidor pelo laboratório, e a disponibilização pública dos dados, se faz necessário o desenvolvimento e manutenção de uma série de ferramentas para administração e segurança dessa infra-estrutura. Isso inclui segurança de rede e web services; gerenciamento de ferramentas de bioinformática; gerenciamento da aplicação web e do banco de dados; criação, manutenção e segurança de acesso via conexões SSH e FTP; e gerenciamento de backups das aplicações e do banco de dados. As ferramentas utilizadas no banco requerem um grande volume de memória e necessitam de alto poder de processamento, e esses recursos podem ser utilizados concorrentemente por diferentes usuários. Por isso, é preciso que haja uma série de controles, como versionamento das ferramentas, acompanhamento de processos em execução, utilização de memória e processamento por processo, utilização de memória e processamento por usuário.