Testando e aprimorando conceitos sobre a organização e evolução de DNAs satélites usando genomas completos de Drosophila

• Processo: 09/08738-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2009
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2011
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Orlando Moreira Filho
• Beneficiário: Gustavo Campos e Silva Kuhn
• Instituição Sede: Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
• Assunto(s): Genômica comparativa DNA satélite Heterocromatina Evolução cromossômica Sequências repetitivas de ácido nucleico Drosophila
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: DNA repetitivo | DNA satélite | Evolução Cromossômica | Evolução do Genoma | Heterocromatina | Recombinação | DNAs satelites

Resumo

DNAs satélites fazem parte da fração altamente repetitiva do genoma e consistem, tipicamente, de seqüências de 100 a 800 pb que se repetem em tandem, formando cadeias de milhares de cópias muito similares entre si. Uma fração importante do genoma de muitos organismos (10-50%) é composta por DNAs satélites. Mesmo entre espécies próximas filogeneticamente, DNAs satélites podem divergir drasticamente tanto em composição nucleotídica como no número de cópias e distribuição cromossômica, o que faz deste elemento genômico um importante agente de evolução. A maioria das hipóteses e modelos criados para explicar a evolução dos DNAs satélites foi sugerida nas décadas de 1980 e 1990, quando relativamente poucas seqüências de DNA eram disponíveis. O objetivo do presente projeto é o de explorar a biologia de DNAs satélites nos genomas de 12 espécies de Drosophila cujos genomas foram inteiramente seqüenciados recentemente. O DNA satélite 1.688 de Drosophila, descrito na década de 1970 e presente em todas as 8 espécies do subgrupo melanogaster, será re-analisado usando este grande reservatório de seqüências genômicas. Desta forma, o presente projeto será pioneiro ao colocar a evolução de DNAs satélites no contexto da genômica comparativa do gênero Drosophila. Com os resultados obtidos, modelos modernos e integrativos sobre a organização e evolução de DNAs satélites serão estabelecidos que por sua vez também contribuirão para um melhor entendimento sobre tópicos relacionados à evolução do genoma em eucariotos.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

KUHN, GUSTAVO C. S.; SCHWARZACHER, TRUDE; HESLOP-HARRISON, JOHN S.. The non-regular orbit: three satellite DNAs in Drosophila martensis (buzzatii complex, repleta group) followed three different evolutionary pathways. Molecular Genetics and Genomics, v. 284, n. 4, p. 251-262, OCT 2010. (09/08738-3)

KUHN, G. C. S.; HESLOP-HARRISON, J. S.. Characterization and Genomic Organization of PERI, a Repetitive DNA in the Drosophila buzzatii Cluster Related to DINE-1 Transposable Elements and Highly Abundant in the Sex Chromosomes. Cytogenetic and Genome Research, v. 132, n. 1-2, p. 79-88, 2010. (09/08738-3)

KUHN, GUSTAVO C. S.; KUETTLER, HEINRICH; MOREIRA-FILHO, ORLANDO; HESLOP-HARRISON, JOHN S.. The 1.688 Repetitive DNA of Drosophila: Concerted Evolution at Different Genomic Scales and Association with Genes. Molecular Biology and Evolution, v. 29, n. 1, p. 7-11, JAN 2012. (09/08738-3)