Estudo da omega-conotoxina mviia por dinamica molecular.

• Processo: 00/07017-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2000
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2002
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Química - Físico-química
• Pesquisador responsável: Leo Degreve
• Beneficiário: Luciene Borges Silva
• Instituição Sede: Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Canais iônicos Simulação de dinâmica molecular Conotoxinas Canais de cálcio Proteínas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Canais De Calcio | Canais Ionicos | Conotoxinas | Proteinas | Simulacao Molecular | Solvatacao De Proteinas

Resumo

Simulação de dinâmica molecular (DM) será utilizada no estudo de propriedades estruturais e dinâmicas do polipeptídeo ômega-conotoxina MVIIA em solução aquosa. Este polipeptídeo é uma toxina encontrada no veneno do caracol Conus magnus e possui efeito paralisante por ser inibidora presináptica dos canais de cálcio do tipo N. A estrutura tridimensional da ômega-conotoxina MVIIA determinada por RMN mostrou que o polipeptídeo possui 25 resíduos de aminoácidos que definem uma estrutura compacta formada por uma região de beta folha composta de três fitas beta antiparalelas, interconectadas por 3 ligações disulfeto. As interações intramoleculares e intermoleculares serão descritas pelo campo de força GROMOS e o modelo SPC será adotado para as moléculas de água. Funções de distribuição multivariáveis e funções de correlações temporais permitirão investigar aspectos relacionados à estabilidade, hidratação, e o papel do solvente na manutenção da estrutura polipeptídica. (AU)