Estudos de Docking Molecular Aplicados ao Estudo da Formação de Complexos entre Derivados de Compostos Calcogênios e Enzimas

• Processo: 09/13873-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2009
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2010
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Física
• Pesquisador responsável: Ignez Caracelli
• Beneficiário: Natália Baptistini
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências (FC). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Bauru. Bauru , SP, Brasil
• Assunto(s): Simulação de acoplamento molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: biofisica estrutural | Docking | Organocalcogênios | Biofisica Molecular Estrutural

Resumo

O presente projeto tem por objetivo estudar, tendo como ferramenta o método de docking, a formação de complexos das proteínas ciclooxigenase-1 e ciclooxigenase-2 (COX1 e COX2) com compostos similares aos ebselen e ao difenil disseleneto, com o intuito de produzir conhecimento sobre o modo de ação deste tipo de compostos e sua eventual especificidade. A inibição farmacológica da COX pode causar alívio aos sintomas da inflamação e da dor. Este é o mecanismo de ação de diversos fármacos conhecidos como anti-inflamatórios não esteróides (AINE) como a aspirina e o ibuprofeno. O método de docking exige o conhecimento das coordenadas cristalográficas das proteínas bem como dos ligantes. As coordenadas das proteínas estão disponíveis no Protein Data Bank (PDB) e/ou PDBSUM e os ligantes serão obtidos do CSD (Cambridge Structural Database), ou modelados.