Paralelizacao de software para simulacoes de docking em clusters beowulf.

• Processo: 02/04310-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2002
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2003
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Walter Filgueira de Azevedo Junior
• Beneficiário: Hugo Brandao Uchoa
• Instituição Sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Cristalografia Computação paralela
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Beowulf | Bioinformatica Estrutural | Cdk | Chiquimato Quinase | Computacao Paralela | Cristalografia

Resumo

O presente projeto de iniciação científica tem como objetivo geral facilitar o estudo de macromoléculas biológicas através da utilização de "clusters" Beowulf. Será paralelizado um programa de docking para acelerar o processo de análise de possíveis inibidores de CDK (Cyclin-Dependent Kinases) e da chiquimato quinase do "Mycobacterium tuberculosis", ambas proteínas incluídas na SMOLBNet (Proc. Nro. 01/07532-0). "Clusters" Beowulf são computadores de alto desempenho que possuem uma arquitetura paralela. Esse tipo de arquitetura permite que processos, protocolos e softwares computacionais sejam executados, com uma eficiência muita superior à que vem sendo aplicada até hoje, na maioria das pesquisas em biomoléculas. (AU)