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Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação (Brasil). Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM) (Instituição Sede da última proposta de pesquisa) País de origem: Holanda
Marin Gerard van Heel em auxílios à pesquisa e bolsas apoiadas pela FAPESP.
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Moléculas biológicas em solução são a base da vida. Soluções vitrificadas de complexos biológicos podem agora ser visualizadas diretamente em um microscópio eletrônico criogênico (crio-ME), e fornecer uma janela para a visualização do funcionamento de nossas máquinas biomoleculares. No entanto, as moléculas toleram apenas uma dose muito baixa de exposição a elétrons e os dados brutos são…
Esse curso vem sendo organizado há 13 anos no Brasil, tratando-se de um evento internacional consolidado. O objetivo é formar pós-graduandos e pesquisadores na área de crio-microscopia eletrônica de partículas isoladas ("Single Particle cryo-EM"). Trata-se de um curso de 12 dias com aulas teóricas e práticas que abordam todos os aspectos relativos ao processamento computacional de dados d…
Avaliações de qualidade de estruturas biológicas 3D, como a proteína spike do SARS-CoV-2, são fundamentais para compreender seu modo de ação durante a infecção. A análise de qualidade local revela questões como: quais regiões da proteína spike trimérica são flexíveis ou quais áreas da spike estão acessíveis a anticorpos. A glicosilação das proteínas spike protege as partículas virais, tor…
Este projecto apoiará o desenvolvimento de métodos e software relacionados principalmente com a optimização do processamento de dados "off-line". A transição entre a coleta e pré-processamento de dados "on-line" e o processamento "off-line" é gradual, onde o processamento on-line visa principalmente fornecer feedback rápido para a otimização da coleta de dados de Cryo-EM e o processamento…
Este projeto visa a implementação dos novos métodos de avaliação da qualidade dos instrumentos e dados adquiridos, além de análise on-the-fly do conjunto de dados, na infraestrutura de microscopia eletrônica.
A Microscopia Eletrônica Criogênica (Cryo-EM) evoluiu de "blobologia" em baixa resolução, há algumas décadas, para resultados quase atômicos hoje, permitindo a determinação de novo de estruturas de complexos macromoleculares: uma verdadeira "revolução de resolução". A avaliação da resolução dos resultados de Cryo-EM é realizada usando a medida global de Fourier Shell Correlation (FSC). En…