A FAPESP e a Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amapá (FAPEAP) mantêm um Acordo de Cooperação por meio do qual se comprometem a implementar a cooperação científica e tecnológica entre pesquisadores dos estados de São Paulo e Amapá, mediante o financiamento de projetos conjuntos de pesquisa.
O Acordo de Cooperação Científica ou Tecnológica - assinado em 3 de julho de 2025, válido por cinco anos.