Determinantes de susceptibilidade genética comuns entre periodontite crônica e periodontite apical: avaliação de SNP em conjunto com análise bioinformático de dados clínicos, microbiológicos e inmuno/inflamatórios

Resumo

As periodontites crônica e apical são as causas mais comuns de perdas dentárias em adultos. Ambas doenças parecem compartilhar uma patogêneses comum, incluindo o estabelecimento de uma microbiota patogênica nos tecidos que ativam a resposta imune do hospedeiro, contribuindo para a destruição dos tecidos de suporte dental. A extensão e severidade da resposta inflamatória do hospedeiro encontra-se (pelo menos parcialmente) sob controle genético. Nas últimas décadas, vários polimorfismos de nucleotídeo simples (SNPs) tem sido associados com o aumento na susceptibilidade da destruição periodontal, porém a maioria dos estudos publicados na literatura dependem da estratégia de "genes candidatos" e seus resultados apresentam-se inconclusivos e difíceis de replicar em populações diferentes. Recentemente, tem sido proposta uma nova estratégia para o estudo da susceptibilidade genética da doença periodontal baseada nos dados obtido em estudos de genoma completo (GWA). Esta aproximação tem a vantagem de possibilitar a identificação de genes de risco sem a necessidade prévia da existência de uma associação teórica entre o gene e a patogênese da doença. Adicionalmente, a inclusão de informação clínica, microbiológica e perfis imune/inflamatórios nos estudos genéticos de associação aumentam significativamente a possibilidade de reconhecer verdadeiras relações causais entre os determinantes genéticos e a ocorrência e fenótipo da doença. Em consideração ao anteriormente exposto, nossa proposta é investigar a correlação entre os SNPs de risco para doença periodontal determinados por estudos GWA e a ocorrência de periodontite crônica e periodontite apical em dois estudos de Coortes longitudinais de pacientes recrutados no Brasil (periodontite crônica) e nos Estados Unidos (periodontite apical). Em conjunto com a análise genética, nossa proposta é analisar dados clínicos, microbiológicos e biomarcadores imunes e inflamatórios utilizando ferramentas avançadas de bioinformática. O Projeto será desenvolvido na University of Texas Health Science Center at Houston's School of Dentistry (UTheath), sob a experiência e conhecimentos da supervisora internacional, Prof. Dr. Ariadne Letra, juntamente com os recursos tecnológicos e humanos do Center for Computational Biomedicine (CCB) UTHealth School of Biomedical Informatics. Em resumo, na população portadora de periodontite crônica (75 casos e 50 controles) estudaremos dados clínicos genéticos, microbiológicos (DNA-DNAcheckerboard) e marcadores inflamatórios obtidos no desenvolvimento do projeto original FAPESP 2014/03276-0 e 2014/17886-4. No estudo de periodontite apical, estudaremos dados clínicos, microbiológicos (RT-PCR) e marcadores inflamatórios obtidos de um estudo Coorte de 75 casos e 100 controles recrutados no Department of Endodontics of UTheath`s School of Dentistry. O poder estatístico da amostra foi determinado baseado em estudos prévios do nosso grupo e usando um pacote de software específico (CATS). Para capturar a complexidade de nossos dados e obter modelos significativos com valor preditivo capazes de integrar dados genéticos e características do microambiente periodontal, desenvolveremos estratégias de análise baseadas em hierarquização por clusters e modelamento multinível. Acreditamos que o conhecimento obtido neste projeto contribuirá sobremaneira para o aprofundamento do conhecimento sobre as patogêneses das doenças periodontais, bem como facilitará o desenvolvimento de estratégias específicas de identificação de indivíduos susceptíveis, abrindo a possibilidade para o futuro estabelecimento de novas e mais eficientes alternativas preventivas e terapêuticas para as doenças periodontais. (AU)