TCGA: um painel de germoplasmas de milho tropical para estudos de predição genômica e fenotipagem de alto rendimento

Resumo

Estudos de associação e predição genômica (GS) em painéis de diversidade são essenciais para identificar variações genéticas associadas às características de interesse. Infelizmente, a maioria desses foca em milho temperado, ou em coleção global que não inclui um número suficiente de genótipos de milho tropical. Todavia, considerável esforço tem sido direcionado a melhorar a acurácia da GS. No entanto, enquanto a genotipagem é altamente mecanizada e precisa, a fenotipagem é ainda um processo laborioso, pouco automatizado e altamente sensível às variações ambientais. Além disso, com o advento das mudanças climáticas, alterações ambientais extremas têm complicado a seleção de genótipos superiores e com ampla adaptabilidade. Neste contexto, modelos de GS fundamentados em normas de reação com G x A, modelos de crescimento vegetal e covariáveis ambientais podem proporcionar aumentos significativos na acurácia seletiva. Com isto, o objetivo é desenvolver um painel de diversidade de milho tropical e usá-lo em estudos de predição genômica via modelos considerando caracteres obtidos por fenotipagem de alto rendimento, modelos de crescimento vegetal e covariáveis ambientais. Para isso, 361 linhagens de milho tropical, oriundas da ESALQ-USP, USP, IAC e CIMMYT serão genotipadas e fenotipadas (modo tradicional e via câmeras multiespectrais), em oito ambientes (dois locais, dois anos e duas safras). A partir destes dados diversos modelos de GS serão testados e comparados quanto a coincidência de seleção e acurácia seletiva. Busca-se com isto, além do desenvolvimento de novos modelos de GS e protocolos de fenotipagem de alto rendimento em milho tropical, organizar, caracterizar e disponibilizar para a sociedade científica (dados e material genético) um painel de diversidade de linhagens de milho tropical para servir como base e referência neste tipo de estudo. (AU)