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Análise coarse-graining da interação entre vesículas lipídicas e peptídeos antimicrobianos e penetradores de células

Processo: 19/26557-8
Modalidade de apoio:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
Data de Início da vigência: 22 de setembro de 2020
Data de Término da vigência: 21 de setembro de 2021
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Pesquisador responsável:Iolanda Midea Cuccovia
Beneficiário:Peter Park
Supervisor: Siewert Jan Marrink
Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Instituição Anfitriã: University of Groningen, Holanda  
Vinculado à bolsa:19/03023-8 - Como adentram a membrana os peptídeos penetradores de células?, BP.DD
Assunto(s):Peptídeos catiônicos antimicrobianos   Peptídeos penetradores de células   Simulação de dinâmica molecular   Membranas
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:antimicrobial peptides | Cell Penetrating Peptides | Coarse graining | membranes | molecular dynamics | Vesicles | Membranas

Resumo

Peptídeos catiônicos atuantes em membranas (CMAP) são protagonistas em diversos processos que envolvem membranas lipídicas como formação de poro, fusão de vesículas e ruptura. Dois grupos dos CMAP se destacam como potenciais fármacos inovadores ou como carreadores de fármacos. Peptídeos antimicrobianos (AMP) são uma classe promissora de agentes antimicrobianos e peptídeos penetradores de células (CPP) já estão em fase de teste para drug-delivery. Muitos AMP e CPP foram descobertos e tiveram suas estruturas secundárias analisadas em membranas modelo e testadas in vitro. Contudo, o seu mecanismo de ação exato ainda é obscuro, sendo um obstáculo para o uso dos CMAP na terapêutica. Simulações de Dinâmica Molecular podem fornecer informações atomísticas relevantes e têm sido utilizadas para muitos sistemas peptídeo/membrana, mas em proporções peptídeo/lipídeo baixas.Neste trabalho, propomos estudar o peptídeo TAT e BP100 em vesículas em concentrações crescentes dos peptídeos utilizando um modelo coarse-graining. As informações obtidas nos proverão informações cruciais acerca da agregação de peptídeos, forma da vesícula e o efeito dos peptídeos nas vesículas. Estas são informações que podem ser diretamente comparadas com dados experimentais de membranas modelo, permitindo uma descrição detalhada da ação de AMP e CPP em membranas. (AU)

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Publicações científicas
(As publicações científicas contidas nesta página são originárias da Web of Science ou da SciELO, cujos autores mencionaram números dos processos FAPESP concedidos a Pesquisadores Responsáveis e Beneficiários, sejam ou não autores das publicações. Sua coleta é automática e realizada diretamente naquelas bases bibliométricas)
SOUZA, PAULO C. T.; BORGES-ARAUJO, LUIS; BRASNETT, CHRISTOPHER; MOREIRA, RODRIGO A.; GRUENEWALD, FABIAN; PARK, PETER; WANG, LIGUO; RAZMAZMA, HAFEZ; BORGES-ARAUJO, ANA C.; COFAS-VARGAS, LUIS FERNANDO; et al. . NATURE COMMUNICATIONS, v. 16, n. 1, p. 19-pg., . (19/26557-8)
MORTARA, LAURA; CORTEZ, MATHEUS P.; LACERDA, CAROLINE D.; CARRETERO, GUSTAVO P. B.; SCHREIER, SHIRLEY; CHAIMOVICH, HERNAN; LIMA, FILIPE S.; CUCCOVIA, IOLANDA M.. . Langmuir, v. 41, n. 14, p. 8-pg., . (14/50983-3, 19/03023-8, 18/19838-8, 19/26557-8)
PARK, PETER; MATSUBARA, DANILO K.; BARZOTTO, DOMENICO R.; LIMA, FILIPE S.; CHAIMOVICH, HERNAN; MARRINK, SIEWERT J.; CUCCOVIA, IOLANDA M.. . SCIENTIFIC REPORTS, v. 14, n. 1, p. 13-pg., . (19/26557-8, 14/50983-3, 19/03023-8)