Seleção de Genes e Validação de Agrupamento em Dados de Expressão Gênica

Resumo

O desenvolvimento da tecnologia de microarray possibilitou a geração e coleta de grandes quantidades de dados sobre os mais diversos fenômenos biológicos, motivando a criação de métodos tanto do aprendizado supervisionado quanto não-supervisionado para sua análise. Embora a tecnologia permita a medição dos níveis de expressão de milhares de genes simultaneamente, a análise dos dados gerados apresenta-se como um grande desafio. Neste projeto são apresentadas duas frentes de pesquisa, pertinentes à análise de dados de expressão gênica: a seleção de genes e a validação de agrupamento. A seleção de genes possui por objetivo a identificação de genes informativos que permitam a construção de classificadores eficientes para distinguir, por exemplo, entre diferentes tipos de câncer. O agrupamento de dados, por sua vez, é responsável, por exemplo, pela determinação de funções de genes para os quais poucas informações encontram-se disponíveis ou pela descoberta de novos subtipos de doenças. Por se tratar de uma tarefa não supervisionada, sua validação é essencial para a interpretação e confiabilidade dos resultados obtidos. Os objetivos deste projeto estão relacionados às duas frentes de pesquisa supracitadas. No contexto de seleção de genes são contemplados o estudo e o desenvolvimento de abordagens híbridas e/ou que incorporem conhecimento biológico durante o processo de seleção. Quanto à validação de agrupamento de genes, é apresentada neste projeto uma proposta para o estudo e desenvolvimento de critérios de validação que façam uso do conhecimento biológico previamente disponível. Ainda nesta frente de pesquisa, pretende-se investigar e desenvolver critérios de validação que combinem critérios tradicionais e biológicos de validação. Por fim, propõem-se a avaliação extensiva de critérios de validação no cenário específico de agrupamento de amostras.