Descobrindo o genoma de Passiflora: sequenciamento de BAC-ends e de BACs candidatos

Resumo

Passiflora edulis é uma frutífera tropical de importância econômica, sendo apreciado para o consumo in natura e a produção de suco concentrado, além de ser usado pela indústria cosmética e farmacêutica para gerar compostos derivados. Nosso grupo de pesquisa tem construído um denso corpo de conhecimento sobre as espécies comerciais de Passiflora, caracterizando populações segregantes, sendo que mapas de ligação foram gerados e locos quantitativos associados à produção e qualidade dos frutos foram identificados. Entretanto, pouco se sabe sobre a composição e a organização genômica de Passiflora. Recentemente, em colaboração com H. Bergès, do Centre National de Ressources Génomiques Végétales, INRA, França, nosso grupo construiu uma biblioteca genômica de P. edulis inserida em BACs. Esta biblioteca (Ped-B-Flav) contém ~83.000 clones, cobrindo aproximadamente 6× o genoma da espécie. Em seguida, deu-se início ao sequenciamento das pontas dos insertos da biblioteca (BAC-ends), produzindo 9.700 sequências de boa qualidade. Daí procedeu-se à busca por elementos repetitivos e sequências codificadoras e foi possível investigar, por mapeamento comparativo, as regiões microsintênicas entre Passiflora edulis e espécies próximas com genomas sequenciados, Populus trichocarpa e Vitis vinifera. Visando ampliar o conhecimento existente sobre a genômica da espécie, pretende-se dar continuidade ao sequenciamento de BAC-ends e ao mapeamento genômico comparativo e, ainda, realizar o sequenciamento completo de 100 BACs selecionados (100 kb). Espera-se com esta pesquisa gerar informações sobre o genoma de Passiflora, que serão disponibilizadas à comunidade científica. (AU)