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Criação e curadoria das rotinas computacionais utilizadas para estudar a dinâmica da diversificação

Processo: 19/16233-0
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2019
Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2020
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Ecologia - Ecologia Teórica
Pesquisador responsável:Tiago Bosisio Quental
Beneficiário:Matheus Januario Lopes de Sousa
Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:18/05462-6 - Mecanismos ecológicos na dinâmica da biodiversidade em tempo profundo, AP.R
Assunto(s):Ecologia evolutiva   Programação
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Análises Estatísticas | Dinâmica da diversificação | Linguagem R | programação | Ecologia Evolutiva

Resumo

A disponibilidade de metodos relativos ao estudo da evoluc'ao em largas escalas temporais e espaciais e cada vez maior. Esse acumulo de metodos tem tornado possiveis importantes avanc'os cientificos, porem por virem de diferentes fontes, frequentemente encontramos os metodos em multiplas versoes e implementac'oes (com modificac'oes relevantes entre elas) e em multiplos estagios de amadurecimento (nem sempre os limites do metodos sao explorados ou explicitados ao usuario). Alem disso, o constante avanc'o da area exige que novas rotinas computacionais sejam criadas para uma melhor aproveitamento dos metodos em constante mudanc'a. Com isso surgem desafios associados a compilac'ao, curadoria e automatizac'ao de tarefas frequentes. Assim, o(a) bolsista TT-3 sera responsavel por obter e organizar as rotinas de laboratorio, bem como por criar, curar e aperfeic'oar os codigos em uso pelo laboratorio atualmente. Assim, esperamos que o banco de metodos resultante possa ser usado de maneira confiavel e otimizada, bem como que as analises sejam mais precisas e eficientes.

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
PETRUCCI, BRUNO DO ROSARIO; JANUARIO, MATHEUS; QUENTAL, TIAGO. paleobuddy: An R package for flexible simulations of diversification and fossil sampling. METHODS IN ECOLOGY AND EVOLUTION, v. 13, n. 12, p. 7-pg., . (18/05462-6, 19/16233-0, 21/06780-4)