Análise genômica, transcriptômica e metabolômica integrada de mecanismos (imuno) patogênicos que conduzem à paraparesia espástica tropical / mielopatia associada ao HTLV-1 (HAM/TSP)

Resumo

Introdução: O HTLV-1 foi descrito em 1980 e identificado como o agente causador de ATL e HAM / TSP, além de outras doenças inflamatórias. Estima-se que 15 a 25 milhões de pessoas em todo o mundo estejam infectadas pelo HTLV-1. No entanto, a maioria deles permanece assintomática. Os fatores imunes e genéticos do hospedeiro têm sido associados à patogênese da HAM / TSP, mas faltam grandes estudos genômicos. Objetivo: Analisar se existe uma associação entre a variação genética no genoma e a suscetibilidade HAM / TSP em indivíduos infectados pelo HTLV-1. Material e Métodos: Voluntários foram recrutados no ambulatório de HTLV do Instituto de Infectologia Emílio Ribas (IIER). Um total de 1000 voluntários foram recrutados para este estudo 600 assintomáticos (controles) e 400 pacientes HAM / TSP (casos). A análise de associação ampla do genoma (GWAS) foi realizada em todos os 1000 casos e será combinada com dados de bioensaios (carga proviral do HTLV-1 e proliferação espontânea de células T), transcriptômica e metabolômica em um subgrupo de pacientes. Além de descritiva, univariada e estatísticas multivariadas, análise de biologia de sistemas e mineração de dados combinam dados cross-omics. Conclusão: Estes dados fornecerão as primeiras análises GWAS e cross-omica de HAM / TSP, fornecendo informações sobre sua imunopatogênese, e possivelmente revelando novas estratégias imunoterapêuticas para seu manejo clínico.