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World Wide Web of Plankton Image Curation (www.pic)

Processo: 18/24167-5
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de junho de 2019 - 31 de maio de 2022
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Metodologia e Técnicas da Computação
Convênio/Acordo: Belmont Forum
Pesquisador responsável:Nina Sumiko Tomita Hirata
Beneficiário:Nina Sumiko Tomita Hirata
Pesq. responsável no exterior: Jean-Olivier Irisson
Instituição no exterior: Université Paris-Sorbonne (Paris 4), França
Instituição-sede: Instituto de Matemática e Estatística (IME). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Pesq. associados:Roberto Hirata Junior ; Rubens Mendes Lopes
Assunto(s):Aplicação web  e-Science  Banco de dados  Aprendizado computacional  Plâncton  Imagem digital 

Resumo

Pesquisas científicas estão gerando um número crescente de imagens digitais, de micrografias de células a imagens de galáxias. Instrumentações automatizadas podem capturar muitas imagens, que são automaticamente processadas para gerar dados. Para que esses dados possam ser úteis à comunidade científica e beneficiar o público em geral, a geração deve ser rápida (mesmo para milhões de imagens), consistente, e os dados facilmente compartilháveis. Em ciências ambientais, as questões comuns são: quantos organismos estão persentes em um dado ambiente? O quão diversos eles são? Isto muda com o tempo? O imageamento digital pode ajudar a responder estas questões, particularmente no ambiente subaquático, onde a observação direta pelos humanos é difícil. Por exemplo, imagens de bilhões de organismos planctônicos (i.e., organismos que são carregados pelas correntes) tem sido coletadas e precisam ser analisadas. Plânctons contribuem largamente na regulação do clima na Terra, na produção do oxigênio que respiramos, na alimentação dos peixes que consumimos, etc. Estimar sua abundância e diversidade é portanto crítico. Porém, os esforços para processar e classificar as imagens para estudos ecológicos encontram-se espalhados e não são inter-operáveis. O principal objetivo deste projeto é a criação de aplicações web (World Wide Web of Plankton Image Curation applications -- WWW.PIC) que colete as images de plâncton, permita aos cientistas nomearem-os consistentemente, armazene informações ecológicas associadas (tais como data e localização), e torne todos os dados facilmente acessíveis à comunidade. O serviço deverá aproveitar-se de avanços de ponta em desenho de banco de dados e em aprendizado de máquina para processar bilhões de imagens, será hospedado em servidores web públicos para serem acessados facilmente, e irá fomentar um ambiente de colaboração e compartilhamento valorizado pelo Belmont Forum, passos que acreditamos serem essenciais para o progresso da Ciência. Esta infraestrutura será então usada para os estudos que tem-se mostrado um grande desafio na ausência dela, tais como o monitoramento rápido de plâncton para a avaliação da saúde de um ecossistema, ou estimação global de distribuição da diversidade planctônica e sua contribuição para o armazenamento de carbono e para a produtividade de ecossistemas. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
Pós-doutorado em aprendizado de máquina com bolsa da FAPESP 
Avanço em aprendizado de máquina possibilita novas tecnologias baseadas na análise de imagens 
Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias (4 total):
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Avanço em aprendizado de máquina possibilita novas tecnologias baseadas na análise de imagens 
Avanço em aprendizado de máquina possibilita novas tecnologias baseadas na análise de imagens 
Avanço em aprendizado de máquina possibilita novas tecnologias baseadas na análise de imagens 
Novas tecnologias possibilita análise de imagens por máquinas