A utilidade da GWAS em linhagens parentais para a predição de caracteres de baixa herdabilidade em hibridos de milho tropical

• Processo: 20/01437-7
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2020
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2020
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia
• Pesquisador responsável: Roberto Fritsche Neto
• Beneficiário: Roberto Fritsche Neto
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Melhoramento genético vegetal Predição genômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: GWAS aditiva-dominante | mapeamento associativo | Predição genômica | seleção assistida por marcadores | Melhoramento vegetal

Resumo

O estudo de associação genômica ampla (GWAS) é uma das metodologias mais populares para a investigação do controle genético de características. Esta metodologia tem sido intensivamente realizada em genótipos homozigoticos para identificar variantes causais. Não obstante, a falta de covariância entre o fenótipo das linhagens e seus filhos em espécies de polinização-cruzada (como o milho), gera questionamentos sobre a aplicabilidade dessas descobertas no contexto do melhoramento de hibridos. Para abordar esse tópico, nós incorporamos informações de GWAS previamente reportadas em linhagens genitoras na predição de hibridos considerando um caractere de baixa herdabilidade. Isto foi feito por meio de seleção assistida por marcadores baseada em marcas identificadas nas linhagens modeladas como efeito fixo nos modelos de predição genômica. A GWAS aditiva-dominante dos hibridos, uma pratica pouco convencional, foi também realizada para comparação. Nossos resultados sugerem que incorporar a informação da GWAS obtida nas linhagens genitoras levou a diminuições na capacidade preditiva dos hibridos. De forma correspondente, a GWAS baseada nas linhagens genitoras e hibridos gerou resultados diferentes. Estas inferências não invalidam a GWAS em linhagens genitoras para propósito de seleção, mas indicam que seus resultados podem não ser diretamente uteis para o melhoramento de hibridos. (AU)