Determinação de estrutura 3D de proteínas e materiais nanoestruturados com dados incertos via otimização

• Processo: 21/03269-7
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2022
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2024
• Área do conhecimento: Engenharias - Engenharia de Produção - Pesquisa Operacional
• Pesquisador responsável: Luiz Leduíno de Salles Neto
• Beneficiário: Luiz Leduíno de Salles Neto
• Instituição Sede: Instituto de Ciência e Tecnologia (ICT). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São José dos Campos. São José dos Campos , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Carlile Campos Lavor ; Phillip Duxbury ; Weldon Alexander Lodwick
• Assunto(s): Otimização Materiais nanoestruturados Estrutura tridimensional de proteínas Geometria de distâncias
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Geometria de distâncias | Nanomateriais | otimização | Proteinas | Otimização

Resumo

O projeto visa dar continuidade à pesquisa que o proponente tem realizado sobre o Unassigned Distance Geometry Problem (uDGP), em colaboração com os pesquisadores Phil Duxbury (Michigan State University), Carlile Lavor (Unicamp) e Weldon Lodwick (University of Colorado Denver) e nesta versão traz um detalhamento da metodologia, conforme apontamento dos revisores, bem como sua atualização (subseção 4.4). Também foi reformulado o plano de gestão de dados e o orçamento, que ficou enxuto. Recentemente o proponente, em conjunto com o professores Duxbury, Lavor e Leo Liberti (CNRS-França), publicaram um artigo que apresenta novos modelos de otimização e uma matheurística para o uDGP, considerado até então um problema em aberto da área de geometria de proteínas. Também recentemente o proponente e o pesquisador Weldon Lodwick publicaram um livro organizando a teoria de otimização sob generalizada incerteza. Neste projeto busca-se o desenvolvimento de modelos e métodos para o uDGP com dados incertos, o que ocorre na prática laboratorial, partindo de motivações apresentadas por pesquisadores experimentais da área de nanomateriais e proteínas. Os avanços obtidos no projeto também serão abordados em um livro sobre aplicações da otimização sob generalizada incerteza, contribuindo para divulgação e formação de novos pesquisadores neste campo. (AU)

Publicações científicas

(5)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

SIMOYAMA, FELIPE DE OLIVEIRA; TOMAS, LIVIA RODRIGUES; PINTO, FELIPE MATHEUS; SALLES-NETO, LUIZ LEDUINO; SANTOS, LEONARDO BACELAR LIMA. Optimal rain gauge network to reduce rainfall impacts on urban mobility - a spatial sensitivity analysis. INDUSTRIAL MANAGEMENT & DATA SYSTEMS, v. 122, n. 10, p. 20-pg., 2022-07-18. (21/03269-7, 16/01860-1)

COSTA, T. M.; CHALCO-CANO, Y.; OSUNA-GOMEZ, R.; LODWICK, W. A.. Interval order relationships based on automorphisms and their application to interval optimization. INFORMATION SCIENCES, v. 615, p. 12-pg., 2022-10-21. (21/03269-7)

SIMOYAMA, FELIPE DE OLIVEIRA; CROOPE, SILVANA; TOMAS, LIVIA RODRIGUES; CURTIN, KEVIN M.; PRICE, ASHLEIGH N.; NETO, LUIZ LEDUINO DE SALLES; SANTOS, LEONARDO BACELAR LIMA. Gradual cooperative coverage models for optimally locating rain gauges on an urban transportation network. EXPERT SYSTEMS WITH APPLICATIONS, v. 224, p. 14-pg., 2023-04-06. (21/03269-7, 16/01860-1)

SIMOYAMA, FELIPE DE OLIVEIRA; CROOPE, SILVANA; NETO, LUIZ LEDUINO DE SALLES; SANTOS, LEONARDO BACELAR LIMA. Optimization of rain gauge networks-A systematic literature review. SOCIO-ECONOMIC PLANNING SCIENCES, v. 86, p. 14-pg., 2023-03-11. (21/03269-7, 16/01860-1)

BUTKERAITES, RENAN BRITO CANO; NETO, LUIZ LEDUINO DE SALLES; GENDREAU, MICHEL. A sampling-based multi-objective iterative robust optimization method for Bandwidth Packing Problem. EXPERT SYSTEMS WITH APPLICATIONS, v. 203, p. 8-pg., 2022-10-01. (21/03269-7)