Analise da expressao genica do metabolismo de carboidratos de cana-de-acucar (saccharum officinarum) por meio serial (sage).

• Processo: 02/04024-7
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2002
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2005
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Antonio Vargas de Oliveira Figueira
• Beneficiário: Antonio Vargas de Oliveira Figueira
• Instituição Sede: Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 04/02172-4 - Análise do transcriptoma de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) por análise serial de expressão gênica (SAGE) associada a acúmulo de sacarose, BP.TT; 03/00867-2 - Análise virtual do transcriptoma de cana de açúcar (Saccharum spp.) por estratégia similar a análise serial de experessão gênica (SAGE) aplicada ao banco de ESTs SUCEST, BP.TT
• Assunto(s): Cana-de-açúcar Análise serial da expressão gênica (SAGE) Genômica funcional Expressão gênica Carboidratos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Analise Serial | Cana-De-Acucar | Carboidratos | Expressao Genica | Genomica Funcional | Sage

Resumo

A agroindústria da cana-de-açúcar (Saccharum officinarum L.) é de extrema importância para São Paulo e Brasil. O seqüenciamento e categorização de cerca de 40.000 genes (SUCEST), cujas funções devem ser aplicadas estrategicamente no melhoramento vegetal, viabilizou-a no âmbito científico como modelo em estudos plantas com fotossíntese C-4. Assim, as análises da expressão gênica em nível genômico são promissoras para a identificação em escala das funções gênicas e da expressão diferencial em certas condições. A análise serial da expressão gênica (SAGE) constitui-se como tecnologia apropriada para esse objetivo, sendo o banco de dados do SUCEST apropriado a aplicação da SAGE em cana. A investigação de genes relacionados à biossíntese e metabolismo de carboidratos exemplifica a análise SAGE ligada a um processo biológico, agronômica e industrialmente importante, por análise de qenótipos contrastantes derivados de cruzamento entre dois híbridos comerciais. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

CALSA‚ T.; FIGUEIRA‚ A.. Serial analysis of gene expression in sugarcane (Saccharum spp.) leaves revealed alternative C 4 metabolism and putative antisense transcripts. Plant Molecular Biology, v. 63, n. 6, p. 745-762, 2007. (02/04024-7)