Avaliação do genoma funcional de Bradyrhizobium elkanii: sequenciamento para a seleção dos genes na construção de DNA microarray

• Processo: 04/14816-3
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2005
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2008
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Eliana Gertrudes de Macedo Lemos
• Beneficiário: Eliana Gertrudes de Macedo Lemos
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional Genômica funcional Análise de sequência de DNA Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos Bradyrhizobium elkanii
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biblioteca De Fosmideos | Biblioteca De Shotgun | Bioinformatica | Bradyrhizobium Elkanii | Dna Microarray | Sequenciamento De Dna

Resumo

Os genomas de 3 bactérias fixadoras do nitrogênio, Mesorhizobium loti, Sinorhizobium meliloti e Bradyrhizobium japonicum, foram seqüenciados completamente. Assim, foi revelado que em B. japonicum 34% dos genes mostraram similaridade aos reportados em M. loti e em S. meliloti, enquanto que 23% dos genes foram únicos para essa espécie. Acredita-se que diferenças entre o genoma de B. japonicum e B. elkanii devam existir, uma vez que a especificidade destas duas bactérias para hospedeiros mostra grande diferença. Enquanto B. japonicum é especifica para Glicine max a bactéria B. elkanii nodula, além da soja, outros leguminosas hospedeiras. Neste projeto pretende-se construir e seqüenciar bibliotecas de shotgun e fosmídeos de DNA genômico de B. elkanii, visando o obter cerca de 90% dos genes para comporem o microarranjo de DNA necessário para posterior análises funcionais e comparativas com genomas já concluídos. (AU)