X3DPROT - ferramenta para visualização distribuída de macromoléculas utilizando X3D

• Processo: 07/00624-3
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2007
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2009
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Marcos Roberto Bonfadini
• Beneficiário: Marcos Roberto Bonfadini
• Instituição Sede: Pró-Reitoria de Pós-Graduação, Pesquisa e Extensão. Universidade Anhembi Morumbi (UAM). Instituto Superior de Comunicação Publicitária (ISCP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Proteômica Conformação proteica Imagem tridimensional Sistemas distribuídos Realidade virtual Java
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Programação Java3D e Python | Realidade Virtual | Sistemas Distribuídos | Visualização de Proteínas | X3D | Determinação Estrutural e Modelagem Molecular

Resumo

Nos últimos anos a Proteômica tem ganhado força e sido responsável pela geração de uma enorme quantidade de dados que devem ser interpretados apropriadamente. Todos aqueles que trabalham na área dão boas vindas a qualquer esforço que possa contribuir para a aceleração de todo o processo de pesquisa e desenvolvimento. A estrutura tridimensional de uma proteína determina suas interações com outras moléculas. Do ponto de vista da visualização 3D de uma estrutura protéica, várias aplicações têm sido usadas com um certo grau de sucesso, embora apenas algumas delas tenham a característica de visualização e construção colaborativa via Internet. O sistema de visualização aqui apresentado permitirá a investigação e construção, através de diferentes aspectos estruturais, de um modelo protéico de forma colaborativa via rede. Estas visualizações deverão ocorrer em ambiente de realidade virtual com a criação de moléculas virtuais com o novo formato X3D apoiado pelo consórcio W3, utilizando-se Java3D e protocolos Java RMI para a transmissão e recepção de dados num modelo cliente/servidor com bancos de dados replicados nos mundos virtuais de cada usuário. Uma característica inovadora é a proposta de uma sistema de anotação que tornará possível compartilhar observações particulares dos vários pesquisadores geograficamente distribuídos sobre regiões específicas de um modelo protéico em construção. Estas observações poderão ser feitas nos formatos de áudio, vídeo e texto. (AU)